Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB6O95452 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB6O95452 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB6O95452 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB6O95452 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB6O95452 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB6O95452 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB6O95452 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB6O95452 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB6O95452 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB6O95452 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB6O95452 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB6O95452 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB6O95452 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB6O95452 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB6O95452 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB6O95452 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB6O95452 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB6O95452 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB6O95452 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB6O95452 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB6O95452 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB6O95452 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB6O95452 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB6O95452 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB6O95452 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB6O95452 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB6O95452 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB6O95452 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB6O95452 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB6O95452 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB6O95452 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB6O95452 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJB6O95452 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB6O95452 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB6O95452 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB6O95452 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB6O95452 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB6O95452 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB6O95452 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB6O95452 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB6O95452 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB6O95452 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB6O95452 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB6O95452 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB6O95452 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB6O95452 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB6O95452 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB6O95452 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB6O95452 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB6O95452 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB6O95452 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB6O95452 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB6O95452 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB6O95452 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB6O95452 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB6O95452 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJB6O95452 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJB6O95452 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJB6O95452 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJB6O95452 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJB6O95452 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJB6O95452 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB6O95452 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB6O95452 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB6O95452 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB6O95452 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB6O95452 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB6O95452 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB6O95452 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB6O95452 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB6O95452 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB6O95452 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB6O95452 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB6O95452 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB6O95452 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms