Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIOO75962 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIOO75962 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIOO75962 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIOO75962 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIOO75962 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIOO75962 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIOO75962 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIOO75962 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIOO75962 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIOO75962 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOO75962 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOO75962 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOO75962 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOO75962 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOO75962 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOO75962 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIOO75962 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIOO75962 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIOO75962 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIOO75962 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIOO75962 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIOO75962 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIOO75962 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIOO75962 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIOO75962 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIOO75962 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIOO75962 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIOO75962 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIOO75962 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIOO75962 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIOO75962 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIOO75962 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIOO75962 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIOO75962 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIOO75962 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIOO75962 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIOO75962 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIOO75962 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIOO75962 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIOO75962 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIOO75962 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIOO75962 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIOO75962 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIOO75962 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIOO75962 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIOO75962 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIOO75962 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIOO75962 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIOO75962 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIOO75962 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIOO75962 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIOO75962 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIOO75962 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIOO75962 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIOO75962 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIOO75962 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIOO75962 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIOO75962 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIOO75962 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIOO75962 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIOO75962 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIOO75962 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIOO75962 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIOO75962 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIOO75962 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIOO75962 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIOO75962 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIOO75962 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIOO75962 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIOO75962 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIOO75962 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIOO75962 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIOO75962 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOO75962 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOO75962 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOO75962 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOO75962 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOO75962 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIOO75962 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIOO75962 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIOO75962 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIOO75962 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIOO75962 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIOO75962 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIOO75962 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIOO75962 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIOO75962 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOO75962 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOO75962 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOO75962 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOO75962 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOO75962 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIOO75962 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIOO75962 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIOO75962 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIOO75962 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIOO75962 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIOO75962 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIOO75962 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms