Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC22BO75396 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC22BO75396 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC22BO75396 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms