Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR1O43759 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR1O43759 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR1O43759 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR1O43759 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR1O43759 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR1O43759 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR1O43759 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR1O43759 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR1O43759 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR1O43759 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR1O43759 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR1O43759 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR1O43759 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR1O43759 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR1O43759 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR1O43759 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR1O43759 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR1O43759 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR1O43759 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR1O43759 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR1O43759 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR1O43759 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR1O43759 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR1O43759 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR1O43759 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR1O43759 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR1O43759 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR1O43759 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR1O43759 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR1O43759 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR1O43759 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR1O43759 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR1O43759 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR1O43759 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR1O43759 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR1O43759 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR1O43759 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR1O43759 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR1O43759 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR1O43759 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR1O43759 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR1O43759 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms