Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF5O14894 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF5O14894 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.3 ms