Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QQQ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QQQ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QQQ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QQQ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QQQ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QQQ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QQQ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QQQ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
J3QQQ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
J3QQQ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
J3QQQ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3QQQ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3QQQ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3QQQ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3QQQ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3QQQ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3QQQ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3QQQ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3QQQ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3QQQ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3QQQ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3QQQ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QQQ9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QQQ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QQQ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QQQ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QQQ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QQQ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QQQ9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3QQQ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3QQQ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3QQQ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
J3QQQ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3QQQ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3QQQ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3QQQ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QQQ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QQQ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QQQ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3QQQ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3QQQ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3QQQ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3QQQ9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3QQQ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3QQQ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3QQQ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
J3QQQ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
J3QQQ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3QQQ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3QQQ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3QQQ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3QQQ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
J3QQQ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QQQ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QQQ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QQQ9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QQQ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QQQ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QQQ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3QQQ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3QQQ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3QQQ9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3QQQ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3QQQ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3QQQ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3QQQ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QQQ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QQQ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QQQ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QQQ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QQQ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QQQ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3QQQ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3QQQ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3QQQ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3QQQ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3QQQ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3QQQ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3QQQ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QQQ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QQQ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QQQ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QQQ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3QQQ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3QQQ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3QQQ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3QQQ9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3QQQ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
J3QQQ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QQQ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QQQ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QQQ9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QQQ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QQQ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3QQQ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QQQ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QQQ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QQQ9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3QQQ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms