Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8VRH5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8VRH5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8VRH5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8VRH5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8VRH5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8VRH5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8VRH5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8VRH5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8VRH5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8VRH5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8VRH5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8VRH5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8VRH5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8VRH5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8VRH5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8VRH5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8VRH5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8VRH5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8VRH5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8VRH5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8VRH5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8VRH5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8VRH5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
F8VRH5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8VRH5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8VRH5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8VRH5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8VRH5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8VRH5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8VRH5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8VRH5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8VRH5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8VRH5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8VRH5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8VRH5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8VRH5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8VRH5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8VRH5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8VRH5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8VRH5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8VRH5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8VRH5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8VRH5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8VRH5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8VRH5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
F8VRH5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8VRH5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8VRH5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8VRH5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F8VRH5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F8VRH5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F8VRH5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
F8VRH5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F8VRH5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
F8VRH5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
F8VRH5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
F8VRH5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
F8VRH5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F8VRH5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F8VRH5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F8VRH5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F8VRH5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8VRH5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
F8VRH5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8VRH5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8VRH5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8VRH5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8VRH5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F8VRH5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F8VRH5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F8VRH5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
F8VRH5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F8VRH5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8VRH5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8VRH5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8VRH5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8VRH5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8VRH5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8VRH5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
F8VRH5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8VRH5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8VRH5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8VRH5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8VRH5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8VRH5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8VRH5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8VRH5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
F8VRH5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8VRH5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8VRH5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8VRH5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8VRH5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8VRH5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8VRH5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8VRH5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F8VRH5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
F8VRH5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F8VRH5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
F8VRH5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms