Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROB1E7EW31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROB1E7EW31 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PROB1E7EW31 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.6 ms