Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4orf47A7E2U8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C4orf47A7E2U8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf47A7E2U8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4orf47A7E2U8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms