Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT8L1PA6NM43 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT8L1PA6NM43 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT8L1PA6NM43 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT8L1PA6NM43 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8L1PA6NM43 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.9 ms