Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMX3A6NHT5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX3A6NHT5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX3A6NHT5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms