Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms