Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1LA6NFU8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGPEP1LA6NFU8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PGPEP1LA6NFU8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms