Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HELTA6NFD8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HELTA6NFD8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HELTA6NFD8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HELTA6NFD8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HELTA6NFD8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HELTA6NFD8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HELTA6NFD8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HELTA6NFD8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HELTA6NFD8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HELTA6NFD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HELTA6NFD8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HELTA6NFD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HELTA6NFD8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HELTA6NFD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms