Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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