Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A087WXM4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087WXM4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087WXM4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WXM4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms