RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614192.4

SCOC-211, Transcript of short coiled-coil protein, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCOC, Length 1,959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOC-211ENST00000614192 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.45■■■■□ 3.59
SCOC-211ENST00000614192 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.3■■■□□ 2.76
SCOC-211ENST00000614192 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
SCOC-211ENST00000614192 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31■■■□□ 2.55
SCOC-211ENST00000614192 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.93■■■□□ 2.54
SCOC-211ENST00000614192 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.82■■■□□ 2.52
SCOC-211ENST00000614192 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.35■■■□□ 2.45
SCOC-211ENST00000614192 ABCC9O60706 1549 aa30.17■■■□□ 2.42
SCOC-211ENST00000614192 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
SCOC-211ENST00000614192 NACADO15069 1562 aa30■■■□□ 2.39
SCOC-211ENST00000614192 SCRIBQ14160 1630 aa29.86■■■□□ 2.37
SCOC-211ENST00000614192 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.6■■■□□ 2.33
SCOC-211ENST00000614192 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
SCOC-211ENST00000614192 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.12■■■□□ 2.25
SCOC-211ENST00000614192 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.11■■■□□ 2.25
SCOC-211ENST00000614192 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.05■■■□□ 2.24
SCOC-211ENST00000614192 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.98■■■□□ 2.23
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SCOC-211ENST00000614192 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.77■■■□□ 2.2
SCOC-211ENST00000614192 WIZO95785 1651 aa28.76■■■□□ 2.19
SCOC-211ENST00000614192 SMARCA4P51532 1647 aa28.64■■■□□ 2.18
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SCOC-211ENST00000614192 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SCOC-211ENST00000614192 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.28■■■□□ 2.12
SCOC-211ENST00000614192 TRIM41Q8WV44 630 aa28.24■■■□□ 2.11
SCOC-211ENST00000614192 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.21■■■□□ 2.11
SCOC-211ENST00000614192 SMARCA2P51531 1590 aa28.21■■■□□ 2.11
SCOC-211ENST00000614192 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
SCOC-211ENST00000614192 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.08■■■□□ 2.09
SCOC-211ENST00000614192 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.07■■■□□ 2.08
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SCOC-211ENST00000614192 ABCC8Q09428 1581 aa27.79■■■□□ 2.04
SCOC-211ENST00000614192 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
SCOC-211ENST00000614192 NCAPD3P42695 1498 aa27.74■■■□□ 2.03
SCOC-211ENST00000614192 HMGXB3Q12766 1538 aa27.69■■■□□ 2.02
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SCOC-211ENST00000614192 SOGA1O94964 1423 aa27.42■■□□□ 1.98
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SCOC-211ENST00000614192 EEA1Q15075 1411 aa27.38■■□□□ 1.97
SCOC-211ENST00000614192 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.38■■□□□ 1.97
SCOC-211ENST00000614192 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.33■■□□□ 1.97
SCOC-211ENST00000614192 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.29■■□□□ 1.96
SCOC-211ENST00000614192 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.29■■□□□ 1.96
SCOC-211ENST00000614192 CFTRP13569 1480 aa27.28■■□□□ 1.96
SCOC-211ENST00000614192 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.26■■□□□ 1.95
SCOC-211ENST00000614192 TOP2BQ02880 1626 aa27.22■■□□□ 1.95
SCOC-211ENST00000614192 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.16■■□□□ 1.94
SCOC-211ENST00000614192 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SCOC-211ENST00000614192 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.11■■□□□ 1.93
SCOC-211ENST00000614192 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.08■■□□□ 1.92
SCOC-211ENST00000614192 PRDM2Q13029 1718 aa27.06■■□□□ 1.92
SCOC-211ENST00000614192 CUX1P39880 1505 aa27.05■■□□□ 1.92
SCOC-211ENST00000614192 GOLGA3Q08378 1498 aa27.05■■□□□ 1.92
SCOC-211ENST00000614192 CEP162Q5TB80 1403 aa27■■□□□ 1.91
SCOC-211ENST00000614192 KIF21BO75037 1637 aa27■■□□□ 1.91
SCOC-211ENST00000614192 CEP164Q9UPV0 1460 aa27■■□□□ 1.91
SCOC-211ENST00000614192 HRCP23327 699 aa26.97■■□□□ 1.91
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SCOC-211ENST00000614192 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.76■■□□□ 1.87
SCOC-211ENST00000614192 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.73■■□□□ 1.87
SCOC-211ENST00000614192 NESP48681 1621 aa26.69■■□□□ 1.86
SCOC-211ENST00000614192 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SCOC-211ENST00000614192 CLIP1P30622 1438 aa26.66■■□□□ 1.86
SCOC-211ENST00000614192 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.66■■□□□ 1.86
SCOC-211ENST00000614192 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.65■■□□□ 1.86
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SCOC-211ENST00000614192 CUX2O14529 1486 aa26.59■■□□□ 1.85
SCOC-211ENST00000614192 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.58■■□□□ 1.85
SCOC-211ENST00000614192 IGF1RP08069 1367 aa26.54■■□□□ 1.84
SCOC-211ENST00000614192 TOPBP1Q92547 1522 aa26.54■■□□□ 1.84
SCOC-211ENST00000614192 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.51■■□□□ 1.83
SCOC-211ENST00000614192 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SCOC-211ENST00000614192 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.45■■□□□ 1.83
SCOC-211ENST00000614192 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.43■■□□□ 1.82
SCOC-211ENST00000614192 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
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SCOC-211ENST00000614192 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
SCOC-211ENST00000614192 ARAP1Q96P48 1450 aa26.34■■□□□ 1.81
SCOC-211ENST00000614192 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
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SCOC-211ENST00000614192 WDR97A6NE52 1622 aa26.25■■□□□ 1.79
SCOC-211ENST00000614192 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.24■■□□□ 1.79
SCOC-211ENST00000614192 APLP2Q06481 763 aa26.23■■□□□ 1.79
SCOC-211ENST00000614192 CUL7Q14999 1698 aa26.17■■□□□ 1.78
SCOC-211ENST00000614192 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.15■■□□□ 1.78
SCOC-211ENST00000614192 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SCOC-211ENST00000614192 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SCOC-211ENST00000614192 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.09■■□□□ 1.77
SCOC-211ENST00000614192 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.08■■□□□ 1.77
SCOC-211ENST00000614192 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SCOC-211ENST00000614192 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SCOC-211ENST00000614192 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SCOC-211ENST00000614192 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.96■■□□□ 1.75
SCOC-211ENST00000614192 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.93■■□□□ 1.74
SCOC-211ENST00000614192 MAP3K1Q13233 1512 aa25.92■■□□□ 1.74
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