RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608453.1

PRKCQ-AS1-208, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 587 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.56■■□□□ 1.68
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 FOXD1Q16676 465 aa21.19■□□□□ 0.98
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.05■□□□□ 0.8
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ADRA2BP18089 450 aa19.94■□□□□ 0.78
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 MSH5O43196 834 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 POTEDQ86YR6 584 aa18.88■□□□□ 0.61
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.05■□□□□ 0.48
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.98■□□□□ 0.47
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.55■□□□□ 0.4
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.18■□□□□ 0.34
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 KCNA4P22459 653 aa17.05■□□□□ 0.32
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 RNF39Q9H2S5 420 aa16.86■□□□□ 0.29
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.77■□□□□ 0.28
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SLC4A2P04920 1241 aa16.39■□□□□ 0.21
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CAPN15O75808 1086 aa15.9■□□□□ 0.14
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 DSG3P32926 999 aa15.85■□□□□ 0.13
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ZBTB22O15209 634 aa15.78■□□□□ 0.12
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.76■□□□□ 0.11
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 APLP2Q06481 763 aa15.66■□□□□ 0.1
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ABCB7O75027 752 aa15.62■□□□□ 0.09
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.38■□□□□ 0.05
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 POLA2Q14181 598 aa15.37■□□□□ 0.05
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.22■□□□□ 0.03
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.17■□□□□ 0.02
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 OSCARQ8IYS5 282 aa14.92□□□□□ -0.02
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 POTEHQ6S545 545 aa14.79□□□□□ -0.04
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 AKT1S1Q96B36 256 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 FBLN2P98095 1184 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SPDYE6P0CI01 402 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PITPNM1O00562 1244 aa14.52□□□□□ -0.09
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.51□□□□□ -0.09
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.4□□□□□ -0.1
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.34□□□□□ -0.11
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.12
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.22□□□□□ -0.13
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.12□□□□□ -0.15
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CHADLQ6NUI6 762 aa14.03□□□□□ -0.16
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 EVX2Q03828 476 aa14.01□□□□□ -0.17
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PRR29P0C7W0 189 aa14□□□□□ -0.17
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 HAX1O00165 279 aa13.97□□□□□ -0.17
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PROM2Q8N271 834 aa13.93□□□□□ -0.18
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 C19orf67A6NJJ6 358 aa13.88□□□□□ -0.19
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CREBZFQ9NS37 354 aa13.84□□□□□ -0.19
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.81□□□□□ -0.2
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 FKBP8Q14318 412 aa13.7□□□□□ -0.22
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 GABBR2O75899 941 aa13.6□□□□□ -0.23
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.47□□□□□ -0.25
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 POTEIP0CG38 1075 aa13.42□□□□□ -0.26
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 MIER1Q8N108 512 aa13.39□□□□□ -0.27
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PHF12Q96QT6 1004 aa13.39□□□□□ -0.27
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 RASEFQ8IZ41 740 aa13.31□□□□□ -0.28
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CLCN6P51797 869 aa13.3□□□□□ -0.28
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.29□□□□□ -0.28
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.27□□□□□ -0.29
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 NUBP1P53384 320 aa13.24□□□□□ -0.29
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 FBXO3Q9UK99 471 aa13.23□□□□□ -0.29
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PLEKHG5O94827 1062 aa13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88 ms