RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.54■■■□□ 2.48
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.5■■□□□ 1.83
FCHO1-221ENST00000597512 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
FCHO1-221ENST00000597512 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.23■■□□□ 1.63
FCHO1-221ENST00000597512 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.16■■□□□ 1.62
FCHO1-221ENST00000597512 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.15■■□□□ 1.62
FCHO1-221ENST00000597512 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.81■■□□□ 1.56
FCHO1-221ENST00000597512 ABCC9O60706 1549 aa24.79■■□□□ 1.56
FCHO1-221ENST00000597512 NACADO15069 1562 aa24.6■■□□□ 1.53
FCHO1-221ENST00000597512 SCRIBQ14160 1630 aa24.44■■□□□ 1.5
FCHO1-221ENST00000597512 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FCHO1-221ENST00000597512 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.32■■□□□ 1.48
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FCHO1-221ENST00000597512 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
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FCHO1-221ENST00000597512 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.61■■□□□ 1.37
FCHO1-221ENST00000597512 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-221ENST00000597512 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-221ENST00000597512 WIZO95785 1651 aa23.47■■□□□ 1.35
FCHO1-221ENST00000597512 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.45■■□□□ 1.34
FCHO1-221ENST00000597512 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
FCHO1-221ENST00000597512 SMARCA4P51532 1647 aa23.43■■□□□ 1.34
FCHO1-221ENST00000597512 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.31
FCHO1-221ENST00000597512 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-221ENST00000597512 SMARCA2P51531 1590 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.97■■□□□ 1.27
FCHO1-221ENST00000597512 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-221ENST00000597512 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-221ENST00000597512 TRIM41Q8WV44 630 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-221ENST00000597512 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-221ENST00000597512 HMGXB3Q12766 1538 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-221ENST00000597512 NCAPD3P42695 1498 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-221ENST00000597512 ABCC8Q09428 1581 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-221ENST00000597512 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-221ENST00000597512 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-221ENST00000597512 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-221ENST00000597512 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-221ENST00000597512 SYNJ1O43426 1573 aa22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-221ENST00000597512 CFTRP13569 1480 aa22.27■■□□□ 1.16
FCHO1-221ENST00000597512 PRDM2Q13029 1718 aa22.25■■□□□ 1.15
FCHO1-221ENST00000597512 SOGA1O94964 1423 aa22.23■■□□□ 1.15
FCHO1-221ENST00000597512 EEA1Q15075 1411 aa22.23■■□□□ 1.15
FCHO1-221ENST00000597512 TOP2BQ02880 1626 aa22.2■■□□□ 1.14
FCHO1-221ENST00000597512 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.18■■□□□ 1.14
FCHO1-221ENST00000597512 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-221ENST00000597512 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.13■■□□□ 1.13
FCHO1-221ENST00000597512 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.13■■□□□ 1.13
FCHO1-221ENST00000597512 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.08■■□□□ 1.13
FCHO1-221ENST00000597512 CUX1P39880 1505 aa22.06■■□□□ 1.12
FCHO1-221ENST00000597512 GOLGA3Q08378 1498 aa21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-221ENST00000597512 KIF21BO75037 1637 aa21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-221ENST00000597512 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.93■■□□□ 1.1
FCHO1-221ENST00000597512 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.93■■□□□ 1.1
FCHO1-221ENST00000597512 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.91■■□□□ 1.1
FCHO1-221ENST00000597512 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.89■■□□□ 1.09
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FCHO1-221ENST00000597512 NESP48681 1621 aa21.86■■□□□ 1.09
FCHO1-221ENST00000597512 CEP162Q5TB80 1403 aa21.86■■□□□ 1.09
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FCHO1-221ENST00000597512 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.77■■□□□ 1.08
FCHO1-221ENST00000597512 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.77■■□□□ 1.08
FCHO1-221ENST00000597512 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.77■■□□□ 1.08
FCHO1-221ENST00000597512 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.76■■□□□ 1.07
FCHO1-221ENST00000597512 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.74■■□□□ 1.07
FCHO1-221ENST00000597512 PRXQ9BXM0 1461 aa21.73■■□□□ 1.07
FCHO1-221ENST00000597512 TOPBP1Q92547 1522 aa21.71■■□□□ 1.07
FCHO1-221ENST00000597512 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.69■■□□□ 1.06
FCHO1-221ENST00000597512 CUX2O14529 1486 aa21.69■■□□□ 1.06
FCHO1-221ENST00000597512 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.64■■□□□ 1.06
FCHO1-221ENST00000597512 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
FCHO1-221ENST00000597512 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-221ENST00000597512 CLIP1P30622 1438 aa21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-221ENST00000597512 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.58■■□□□ 1.04
FCHO1-221ENST00000597512 IGF1RP08069 1367 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-221ENST00000597512 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.56■■□□□ 1.04
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FCHO1-221ENST00000597512 HRCP23327 699 aa21.49■■□□□ 1.03
FCHO1-221ENST00000597512 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-221ENST00000597512 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-221ENST00000597512 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
FCHO1-221ENST00000597512 CUL7Q14999 1698 aa21.42■■□□□ 1.02
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FCHO1-221ENST00000597512 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.4■■□□□ 1.02
FCHO1-221ENST00000597512 ARAP1Q96P48 1450 aa21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-221ENST00000597512 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-221ENST00000597512 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.32■■□□□ 1
FCHO1-221ENST00000597512 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
FCHO1-221ENST00000597512 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.3■■□□□ 1
FCHO1-221ENST00000597512 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
FCHO1-221ENST00000597512 WDR62O43379 1518 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-221ENST00000597512 APLP2Q06481 763 aa21.27■■□□□ 1
FCHO1-221ENST00000597512 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.26■□□□□ 0.99
FCHO1-221ENST00000597512 PBRM1Q86U86 1689 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-221ENST00000597512 ERCC6Q03468 1493 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-221ENST00000597512 IFT140Q96RY7 1462 aa21.19■□□□□ 0.98
FCHO1-221ENST00000597512 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
FCHO1-221ENST00000597512 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.14■□□□□ 0.97
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