RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584915.1

LPIN2-204, Transcript of lipin 2, human

TSL 3

Gene LPIN2, Length 491 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN2-204	ENST00000584915	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
LPIN2-204	ENST00000584915	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		18.3	■□□□□ 0.52
LPIN2-204	ENST00000584915	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	16.71	■□□□□ 0.27
LPIN2-204	ENST00000584915	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	16.44	■□□□□ 0.22
LPIN2-204	ENST00000584915	FOXD1	Q16676	465 aa		15.58	■□□□□ 0.08
LPIN2-204	ENST00000584915	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		14.9	□□□□□ -0.02
LPIN2-204	ENST00000584915	POTED	Q86YR6	584 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LPIN2-204	ENST00000584915	ABCC9	O60706	1549 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LPIN2-204	ENST00000584915	MSH5	O43196	834 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LPIN2-204	ENST00000584915	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LPIN2-204	ENST00000584915	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		14.65	□□□□□ -0.06
LPIN2-204	ENST00000584915	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
LPIN2-204	ENST00000584915	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		14.47	□□□□□ -0.09
LPIN2-204	ENST00000584915	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		14.36	□□□□□ -0.11
LPIN2-204	ENST00000584915	ADRA2B	P18089	450 aa		14.32	□□□□□ -0.12
LPIN2-204	ENST00000584915	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LPIN2-204	ENST00000584915	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
LPIN2-204	ENST00000584915	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LPIN2-204	ENST00000584915	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LPIN2-204	ENST00000584915	TRIM41	Q8WV44	630 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LPIN2-204	ENST00000584915	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LPIN2-204	ENST00000584915	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LPIN2-204	ENST00000584915	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LPIN2-204	ENST00000584915	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LPIN2-204	ENST00000584915	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LPIN2-204	ENST00000584915	NACAD	O15069	1562 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LPIN2-204	ENST00000584915	CUX2	O14529	1486 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LPIN2-204	ENST00000584915	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
LPIN2-204	ENST00000584915	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
LPIN2-204	ENST00000584915	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		12.91	□□□□□ -0.34
LPIN2-204	ENST00000584915	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.88	□□□□□ -0.35
LPIN2-204	ENST00000584915	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LPIN2-204	ENST00000584915	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
LPIN2-204	ENST00000584915	ERCC6	Q03468	1493 aa		12.76	□□□□□ -0.37
LPIN2-204	ENST00000584915	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		12.71	□□□□□ -0.37
LPIN2-204	ENST00000584915	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LPIN2-204	ENST00000584915	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
LPIN2-204	ENST00000584915	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
LPIN2-204	ENST00000584915	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
LPIN2-204	ENST00000584915	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		12.56	□□□□□ -0.4
LPIN2-204	ENST00000584915	KCNA4	P22459	653 aa		12.53	□□□□□ -0.4
LPIN2-204	ENST00000584915	RNF39	Q9H2S5	420 aa		12.51	□□□□□ -0.41
LPIN2-204	ENST00000584915	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
LPIN2-204	ENST00000584915	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
LPIN2-204	ENST00000584915	SCRIB	Q14160	1630 aa		12.4	□□□□□ -0.42
LPIN2-204	ENST00000584915	NES	P48681	1621 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LPIN2-204	ENST00000584915	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LPIN2-204	ENST00000584915	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN2-204	ENST00000584915	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN2-204	ENST00000584915	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN2-204	ENST00000584915	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
LPIN2-204	ENST00000584915	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LPIN2-204	ENST00000584915	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LPIN2-204	ENST00000584915	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
LPIN2-204	ENST00000584915	SMARCA2	P51531	1590 aa		12.22	□□□□□ -0.45
LPIN2-204	ENST00000584915	NCAPD3	P42695	1498 aa		12.21	□□□□□ -0.45
LPIN2-204	ENST00000584915	ARHGEF11	O15085	1522 aa		12.2	□□□□□ -0.46
LPIN2-204	ENST00000584915	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		12.15	□□□□□ -0.46
LPIN2-204	ENST00000584915	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LPIN2-204	ENST00000584915	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		12.08	□□□□□ -0.48
LPIN2-204	ENST00000584915	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LPIN2-204	ENST00000584915	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	12.05	□□□□□ -0.48	9e-12	■□□□□ 9.2
LPIN2-204	ENST00000584915	WDR62	O43379	1518 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LPIN2-204	ENST00000584915	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LPIN2-204	ENST00000584915	ARAP1	Q96P48	1450 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LPIN2-204	ENST00000584915	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LPIN2-204	ENST00000584915	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LPIN2-204	ENST00000584915	HMGXB3	Q12766	1538 aa		12	□□□□□ -0.49
LPIN2-204	ENST00000584915	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LPIN2-204	ENST00000584915	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
LPIN2-204	ENST00000584915	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LPIN2-204	ENST00000584915	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		11.81	□□□□□ -0.52
LPIN2-204	ENST00000584915	SOCS7	O14512	581 aa		11.8	□□□□□ -0.52
LPIN2-204	ENST00000584915	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
LPIN2-204	ENST00000584915	FBXO41	Q8TF61	875 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LPIN2-204	ENST00000584915	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.52
LPIN2-204	ENST00000584915	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LPIN2-204	ENST00000584915		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
LPIN2-204	ENST00000584915	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LPIN2-204	ENST00000584915	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LPIN2-204	ENST00000584915	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LPIN2-204	ENST00000584915	SMARCA4	P51532	1647 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LPIN2-204	ENST00000584915	CAPN15	O75808	1086 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LPIN2-204	ENST00000584915	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LPIN2-204	ENST00000584915	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LPIN2-204	ENST00000584915	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LPIN2-204	ENST00000584915	DSG3	P32926	999 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LPIN2-204	ENST00000584915	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LPIN2-204	ENST00000584915	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LPIN2-204	ENST00000584915	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LPIN2-204	ENST00000584915	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LPIN2-204	ENST00000584915	CHD1	O14646	1710 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LPIN2-204	ENST00000584915	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LPIN2-204	ENST00000584915	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		11.54	□□□□□ -0.56
LPIN2-204	ENST00000584915	IFT140	Q96RY7	1462 aa		11.54	□□□□□ -0.56
LPIN2-204	ENST00000584915	POTEH	Q6S545	545 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LPIN2-204	ENST00000584915	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		11.51	□□□□□ -0.57
LPIN2-204	ENST00000584915	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
LPIN2-204	ENST00000584915	ZBTB22	O15209	634 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LPIN2-204	ENST00000584915	FBLN2	P98095	1184 aa		11.49	□□□□□ -0.57

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