RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536072.6

EDC4-202, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, humanhuman

TSL 2

Gene EDC4, Length 2,375 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4-202ENST00000536072 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36■■■■□ 3.35
EDC4-202ENST00000536072 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.94■■■□□ 2.54
EDC4-202ENST00000536072 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
EDC4-202ENST00000536072 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.12■■■□□ 2.41
EDC4-202ENST00000536072 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.88■■■□□ 2.37
EDC4-202ENST00000536072 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.61■■■□□ 2.33
EDC4-202ENST00000536072 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
EDC4-202ENST00000536072 ABCC9O60706 1549 aa29.05■■■□□ 2.24
EDC4-202ENST00000536072 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.99■■■□□ 2.23
EDC4-202ENST00000536072 SCRIBQ14160 1630 aa28.8■■■□□ 2.2
EDC4-202ENST00000536072 NACADO15069 1562 aa28.73■■■□□ 2.19
EDC4-202ENST00000536072 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.38■■■□□ 2.13
EDC4-202ENST00000536072 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
EDC4-202ENST00000536072 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.21■■■□□ 2.11
EDC4-202ENST00000536072 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.07■■■□□ 2.08
EDC4-202ENST00000536072 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.93■■■□□ 2.06
EDC4-202ENST00000536072 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.89■■■□□ 2.06
EDC4-202ENST00000536072 WIZO95785 1651 aa27.73■■■□□ 2.03
EDC4-202ENST00000536072 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
EDC4-202ENST00000536072 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
EDC4-202ENST00000536072 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.6■■■□□ 2.01
EDC4-202ENST00000536072 SMARCA4P51532 1647 aa27.54■■■□□ 2
EDC4-202ENST00000536072 TRIM41Q8WV44 630 aa27.35■■□□□ 1.97
EDC4-202ENST00000536072 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
EDC4-202ENST00000536072 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.3■■□□□ 1.96
EDC4-202ENST00000536072 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.18■■□□□ 1.94
EDC4-202ENST00000536072 SMARCA2P51531 1590 aa27.16■■□□□ 1.94
EDC4-202ENST00000536072 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
EDC4-202ENST00000536072 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.08■■□□□ 1.93
EDC4-202ENST00000536072 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
EDC4-202ENST00000536072 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.98■■□□□ 1.91
EDC4-202ENST00000536072 ABCC8Q09428 1581 aa26.87■■□□□ 1.89
EDC4-202ENST00000536072 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
EDC4-202ENST00000536072 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.77■■□□□ 1.88
EDC4-202ENST00000536072 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.66■■□□□ 1.86
EDC4-202ENST00000536072 NCAPD3P42695 1498 aa26.58■■□□□ 1.84
EDC4-202ENST00000536072 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
EDC4-202ENST00000536072 HMGXB3Q12766 1538 aa26.54■■□□□ 1.84
EDC4-202ENST00000536072 SOGA1O94964 1423 aa26.51■■□□□ 1.83
EDC4-202ENST00000536072 SYNJ1O43426 1573 aa26.43■■□□□ 1.82
EDC4-202ENST00000536072 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.41■■□□□ 1.82
EDC4-202ENST00000536072 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
EDC4-202ENST00000536072 EEA1Q15075 1411 aa26.35■■□□□ 1.81
EDC4-202ENST00000536072 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.32■■□□□ 1.8
EDC4-202ENST00000536072 HRCP23327 699 aa26.28■■□□□ 1.8
EDC4-202ENST00000536072 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.2■■□□□ 1.78
EDC4-202ENST00000536072 CFTRP13569 1480 aa26.19■■□□□ 1.78
EDC4-202ENST00000536072 TOP2BQ02880 1626 aa26.18■■□□□ 1.78
EDC4-202ENST00000536072 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.15■■□□□ 1.78
EDC4-202ENST00000536072 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
EDC4-202ENST00000536072 CEP162Q5TB80 1403 aa26.12■■□□□ 1.77
EDC4-202ENST00000536072 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.11■■□□□ 1.77
EDC4-202ENST00000536072 GOLGA3Q08378 1498 aa26.11■■□□□ 1.77
EDC4-202ENST00000536072 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
EDC4-202ENST00000536072 CUX1P39880 1505 aa26.05■■□□□ 1.76
EDC4-202ENST00000536072 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.03■■□□□ 1.76
EDC4-202ENST00000536072 KIF21BO75037 1637 aa26.01■■□□□ 1.75
EDC4-202ENST00000536072 CADPSQ9ULU8 1353 aa26■■□□□ 1.75
EDC4-202ENST00000536072 PRDM2Q13029 1718 aa25.95■■□□□ 1.75
EDC4-202ENST00000536072 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.9■■□□□ 1.74
EDC4-202ENST00000536072 KIF27Q86VH2 1401 aa25.78■■□□□ 1.72
EDC4-202ENST00000536072 CLIP1P30622 1438 aa25.77■■□□□ 1.72
EDC4-202ENST00000536072 PRXQ9BXM0 1461 aa25.76■■□□□ 1.71
EDC4-202ENST00000536072 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
EDC4-202ENST00000536072 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.74■■□□□ 1.71
EDC4-202ENST00000536072 NESP48681 1621 aa25.71■■□□□ 1.71
EDC4-202ENST00000536072 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.7■■□□□ 1.71
EDC4-202ENST00000536072 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
EDC4-202ENST00000536072 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.68■■□□□ 1.7
EDC4-202ENST00000536072 CUX2O14529 1486 aa25.65■■□□□ 1.7
EDC4-202ENST00000536072 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.63■■□□□ 1.69
EDC4-202ENST00000536072 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.59■■□□□ 1.69
EDC4-202ENST00000536072 IGF1RP08069 1367 aa25.55■■□□□ 1.68
EDC4-202ENST00000536072 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.54■■□□□ 1.68
EDC4-202ENST00000536072 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.54■■□□□ 1.68
EDC4-202ENST00000536072 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
EDC4-202ENST00000536072 TOPBP1Q92547 1522 aa25.51■■□□□ 1.67
EDC4-202ENST00000536072 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.47■■□□□ 1.67
EDC4-202ENST00000536072 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
EDC4-202ENST00000536072 ARAP1Q96P48 1450 aa25.44■■□□□ 1.66
EDC4-202ENST00000536072 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.43■■□□□ 1.66
EDC4-202ENST00000536072 APLP2Q06481 763 aa25.42■■□□□ 1.66
EDC4-202ENST00000536072 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
EDC4-202ENST00000536072 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
EDC4-202ENST00000536072 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.39■■□□□ 1.65
EDC4-202ENST00000536072 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.38■■□□□ 1.65
EDC4-202ENST00000536072 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.32■■□□□ 1.64
EDC4-202ENST00000536072 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
EDC4-202ENST00000536072 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.29■■□□□ 1.64
EDC4-202ENST00000536072 WDR97A6NE52 1622 aa25.21■■□□□ 1.63
EDC4-202ENST00000536072 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
EDC4-202ENST00000536072 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
EDC4-202ENST00000536072 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
EDC4-202ENST00000536072 CUL7Q14999 1698 aa25.15■■□□□ 1.62
EDC4-202ENST00000536072 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.12■■□□□ 1.61
EDC4-202ENST00000536072 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.1■■□□□ 1.61
EDC4-202ENST00000536072 P3H3Q8IVL6 736 aa25.06■■□□□ 1.6
EDC4-202ENST00000536072 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
EDC4-202ENST00000536072 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.03■■□□□ 1.6
EDC4-202ENST00000536072 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.99■■□□□ 1.59
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