RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533444.1

CYC1-204, Transcript of cytochrome c1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYC1, Length 1,832 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYC1-204ENST00000533444 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.81■■■■■ 7.01
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CYC1-204ENST00000533444 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.48■■■■■ 5.35
CYC1-204ENST00000533444 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.24■■■■■ 5.31
CYC1-204ENST00000533444 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.8■■■■■ 5.24
CYC1-204ENST00000533444 ABCC9O60706 1549 aa47.44■■■■■ 5.19
CYC1-204ENST00000533444 NACADO15069 1562 aa47.27■■■■■ 5.16
CYC1-204ENST00000533444 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
CYC1-204ENST00000533444 SCRIBQ14160 1630 aa46.97■■■■■ 5.11
CYC1-204ENST00000533444 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.69■■■■■ 5.06
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CYC1-204ENST00000533444 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.76■■■■■ 4.92
CYC1-204ENST00000533444 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.6■■■■■ 4.89
CYC1-204ENST00000533444 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.45■■■■■ 4.87
CYC1-204ENST00000533444 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.42■■■■■ 4.86
CYC1-204ENST00000533444 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
CYC1-204ENST00000533444 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.23■■■■■ 4.83
CYC1-204ENST00000533444 WIZO95785 1651 aa45.14■■■■■ 4.82
CYC1-204ENST00000533444 SMARCA4P51532 1647 aa45.07■■■■■ 4.81
CYC1-204ENST00000533444 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.85■■■■■ 4.771e-15■■■■■ 40.8
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CYC1-204ENST00000533444 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.5■■■■■ 4.71
CYC1-204ENST00000533444 SMARCA2P51531 1590 aa44.32■■■■■ 4.68
CYC1-204ENST00000533444 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
CYC1-204ENST00000533444 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.24■■■■■ 4.67
CYC1-204ENST00000533444 TRIM41Q8WV44 630 aa44.17■■■■■ 4.66
CYC1-204ENST00000533444 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.1■■■■■ 4.65
CYC1-204ENST00000533444 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
CYC1-204ENST00000533444 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.67■■■■■ 4.58
CYC1-204ENST00000533444 HMGXB3Q12766 1538 aa43.65■■■■■ 4.58
CYC1-204ENST00000533444 NCAPD3P42695 1498 aa43.59■■■■■ 4.57
CYC1-204ENST00000533444 ABCC8Q09428 1581 aa43.56■■■■■ 4.56
CYC1-204ENST00000533444 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
CYC1-204ENST00000533444 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.21■■■■■ 4.512e-6■□□□□ 11.1
CYC1-204ENST00000533444 EEA1Q15075 1411 aa43.05■■■■■ 4.48
CYC1-204ENST00000533444 SYNJ1O43426 1573 aa43.01■■■■■ 4.48
CYC1-204ENST00000533444 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.98■■■■■ 4.47
CYC1-204ENST00000533444 SOGA1O94964 1423 aa42.89■■■■■ 4.46
CYC1-204ENST00000533444 CFTRP13569 1480 aa42.85■■■■■ 4.45
CYC1-204ENST00000533444 TOP2BQ02880 1626 aa42.79■■■■■ 4.44
CYC1-204ENST00000533444 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.75■■■■■ 4.43
CYC1-204ENST00000533444 PRDM2Q13029 1718 aa42.75■■■■■ 4.43
CYC1-204ENST00000533444 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.69■■■■■ 4.43
CYC1-204ENST00000533444 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.66■■■■■ 4.42
CYC1-204ENST00000533444 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.64■■■■■ 4.42
CYC1-204ENST00000533444 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.53■■■■■ 4.4
CYC1-204ENST00000533444 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.52■■■■■ 4.4
CYC1-204ENST00000533444 GOLGA3Q08378 1498 aa42.48■■■■■ 4.39
CYC1-204ENST00000533444 CUX1P39880 1505 aa42.46■■■■■ 4.39
CYC1-204ENST00000533444 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.46■■■■■ 4.39
CYC1-204ENST00000533444 KIF21BO75037 1637 aa42.45■■■■■ 4.39
CYC1-204ENST00000533444 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.4■■■■■ 4.38
CYC1-204ENST00000533444 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
CYC1-204ENST00000533444 CEP162Q5TB80 1403 aa42.3■■■■■ 4.36
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CYC1-204ENST00000533444 KIF27Q86VH2 1401 aa42.06■■■■■ 4.32
CYC1-204ENST00000533444 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.03■■■■■ 4.32
CYC1-204ENST00000533444 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.03■■■■■ 4.32
CYC1-204ENST00000533444 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42■■■■■ 4.31
CYC1-204ENST00000533444 HRCP23327 699 aa41.98■■■■■ 4.31
CYC1-204ENST00000533444 PRXQ9BXM0 1461 aa41.96■■■■■ 4.31
CYC1-204ENST00000533444 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.89■■■■■ 4.3
CYC1-204ENST00000533444 NESP48681 1621 aa41.88■■■■■ 4.3
CYC1-204ENST00000533444 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.88■■■■■ 4.29
CYC1-204ENST00000533444 CLIP1P30622 1438 aa41.8■■■■■ 4.28
CYC1-204ENST00000533444 CUX2O14529 1486 aa41.77■■■■■ 4.28
CYC1-204ENST00000533444 TOPBP1Q92547 1522 aa41.72■■■■■ 4.27
CYC1-204ENST00000533444 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.66■■■■■ 4.26
CYC1-204ENST00000533444 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.24
CYC1-204ENST00000533444 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.56■■■■■ 4.24
CYC1-204ENST00000533444 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
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CYC1-204ENST00000533444 IGF1RP08069 1367 aa41.54■■■■■ 4.24
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CYC1-204ENST00000533444 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.41■■■■■ 4.22
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CYC1-204ENST00000533444 WDR97A6NE52 1622 aa41.37■■■■■ 4.21
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CYC1-204ENST00000533444 CUL7Q14999 1698 aa41.27■■■■■ 4.2
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CYC1-204ENST00000533444 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.17■■■■■ 4.18
CYC1-204ENST00000533444 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
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CYC1-204ENST00000533444 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.13■■■■■ 4.18
CYC1-204ENST00000533444 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
CYC1-204ENST00000533444 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.1■■■■■ 4.17
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CYC1-204ENST00000533444 GAPVD1Q14C86 1478 aa41■■■■■ 4.15
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CYC1-204ENST00000533444 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.92■■■■■ 4.14
CYC1-204ENST00000533444 WDR62O43379 1518 aa40.85■■■■■ 4.13
CYC1-204ENST00000533444 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.83■■■■■ 4.13
CYC1-204ENST00000533444 PBRM1Q86U86 1689 aa40.76■■■■■ 4.12
CYC1-204ENST00000533444 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.72■■■■■ 4.11
CYC1-204ENST00000533444 MAP3K1Q13233 1512 aa40.72■■■■■ 4.11
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