RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524090.5

MTSS1-216, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MTSS1, Length 2,166 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-216ENST00000524090 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.33■■■□□ 2.61
MTSS1-216ENST00000524090 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.21■■□□□ 1.95
MTSS1-216ENST00000524090 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
MTSS1-216ENST00000524090 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.91■■□□□ 1.74
MTSS1-216ENST00000524090 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.78■■□□□ 1.72
MTSS1-216ENST00000524090 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.73■■□□□ 1.71
MTSS1-216ENST00000524090 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.48■■□□□ 1.67
MTSS1-216ENST00000524090 ABCC9O60706 1549 aa25.36■■□□□ 1.65
MTSS1-216ENST00000524090 NACADO15069 1562 aa25.23■■□□□ 1.63
MTSS1-216ENST00000524090 SCRIBQ14160 1630 aa25.06■■□□□ 1.6
MTSS1-216ENST00000524090 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
MTSS1-216ENST00000524090 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.94■■□□□ 1.58
MTSS1-216ENST00000524090 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.53■■□□□ 1.52
MTSS1-216ENST00000524090 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
MTSS1-216ENST00000524090 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.3■■□□□ 1.48
MTSS1-216ENST00000524090 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.22■■□□□ 1.47
MTSS1-216ENST00000524090 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
MTSS1-216ENST00000524090 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.17■■□□□ 1.46
MTSS1-216ENST00000524090 WIZO95785 1651 aa24.07■■□□□ 1.44
MTSS1-216ENST00000524090 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.07■■□□□ 1.44
MTSS1-216ENST00000524090 SMARCA4P51532 1647 aa24.04■■□□□ 1.44
MTSS1-216ENST00000524090 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.434e-8■□□□□ 9.7
MTSS1-216ENST00000524090 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
MTSS1-216ENST00000524090 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.73■■□□□ 1.39
MTSS1-216ENST00000524090 SMARCA2P51531 1590 aa23.6■■□□□ 1.37
MTSS1-216ENST00000524090 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
MTSS1-216ENST00000524090 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.55■■□□□ 1.36
MTSS1-216ENST00000524090 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.52■■□□□ 1.36
MTSS1-216ENST00000524090 TRIM41Q8WV44 630 aa23.45■■□□□ 1.35
MTSS1-216ENST00000524090 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
MTSS1-216ENST00000524090 HMGXB3Q12766 1538 aa23.29■■□□□ 1.32
MTSS1-216ENST00000524090 NCAPD3P42695 1498 aa23.25■■□□□ 1.31
MTSS1-216ENST00000524090 ABCC8Q09428 1581 aa23.2■■□□□ 1.3
MTSS1-216ENST00000524090 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.16■■□□□ 1.3
MTSS1-216ENST00000524090 HRCP23327 699 aa23.07■■□□□ 1.28
MTSS1-216ENST00000524090 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
MTSS1-216ENST00000524090 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23■■□□□ 1.27
MTSS1-216ENST00000524090 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
MTSS1-216ENST00000524090 SYNJ1O43426 1573 aa22.91■■□□□ 1.26
MTSS1-216ENST00000524090 PRDM2Q13029 1718 aa22.87■■□□□ 1.25
MTSS1-216ENST00000524090 EEA1Q15075 1411 aa22.85■■□□□ 1.25
MTSS1-216ENST00000524090 CFTRP13569 1480 aa22.84■■□□□ 1.25
MTSS1-216ENST00000524090 SOGA1O94964 1423 aa22.8■■□□□ 1.24
MTSS1-216ENST00000524090 TOP2BQ02880 1626 aa22.8■■□□□ 1.24
MTSS1-216ENST00000524090 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.78■■□□□ 1.24
MTSS1-216ENST00000524090 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.76■■□□□ 1.23
MTSS1-216ENST00000524090 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.69■■□□□ 1.22
MTSS1-216ENST00000524090 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.69■■□□□ 1.22
MTSS1-216ENST00000524090 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.68■■□□□ 1.22
MTSS1-216ENST00000524090 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.65■■□□□ 1.22
MTSS1-216ENST00000524090 CUX1P39880 1505 aa22.62■■□□□ 1.21
MTSS1-216ENST00000524090 KIF21BO75037 1637 aa22.57■■□□□ 1.2
MTSS1-216ENST00000524090 GOLGA3Q08378 1498 aa22.56■■□□□ 1.2
MTSS1-216ENST00000524090 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.53■■□□□ 1.2
MTSS1-216ENST00000524090 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.53■■□□□ 1.2
MTSS1-216ENST00000524090 CEP162Q5TB80 1403 aa22.45■■□□□ 1.19
MTSS1-216ENST00000524090 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
MTSS1-216ENST00000524090 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.45■■□□□ 1.18
MTSS1-216ENST00000524090 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.45■■□□□ 1.18
MTSS1-216ENST00000524090 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
MTSS1-216ENST00000524090 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
MTSS1-216ENST00000524090 NESP48681 1621 aa22.38■■□□□ 1.17
MTSS1-216ENST00000524090 KIF27Q86VH2 1401 aa22.38■■□□□ 1.17
MTSS1-216ENST00000524090 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.34■■□□□ 1.17
MTSS1-216ENST00000524090 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.34■■□□□ 1.17
MTSS1-216ENST00000524090 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.33■■□□□ 1.17
MTSS1-216ENST00000524090 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.33■■□□□ 1.16
MTSS1-216ENST00000524090 PRXQ9BXM0 1461 aa22.31■■□□□ 1.16
MTSS1-216ENST00000524090 TOPBP1Q92547 1522 aa22.25■■□□□ 1.15
MTSS1-216ENST00000524090 CUX2O14529 1486 aa22.24■■□□□ 1.15
MTSS1-216ENST00000524090 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.23■■□□□ 1.15
MTSS1-216ENST00000524090 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.22■■□□□ 1.15
MTSS1-216ENST00000524090 CLIP1P30622 1438 aa22.19■■□□□ 1.14
MTSS1-216ENST00000524090 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.18■■□□□ 1.14
MTSS1-216ENST00000524090 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
MTSS1-216ENST00000524090 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
MTSS1-216ENST00000524090 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.14■■□□□ 1.13
MTSS1-216ENST00000524090 IGF1RP08069 1367 aa22.11■■□□□ 1.13
MTSS1-216ENST00000524090 WDR97A6NE52 1622 aa22.09■■□□□ 1.13
MTSS1-216ENST00000524090 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.08■■□□□ 1.12
MTSS1-216ENST00000524090 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.06■■□□□ 1.12
MTSS1-216ENST00000524090 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.03■■□□□ 1.12
MTSS1-216ENST00000524090 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
MTSS1-216ENST00000524090 CUL7Q14999 1698 aa22■■□□□ 1.11
MTSS1-216ENST00000524090 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.96■■□□□ 1.11
MTSS1-216ENST00000524090 ARAP1Q96P48 1450 aa21.94■■□□□ 1.1
MTSS1-216ENST00000524090 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
MTSS1-216ENST00000524090 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.93■■□□□ 1.1
MTSS1-216ENST00000524090 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
MTSS1-216ENST00000524090 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.87■■□□□ 1.09
MTSS1-216ENST00000524090 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.87■■□□□ 1.09
MTSS1-216ENST00000524090 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.84■■□□□ 1.09
MTSS1-216ENST00000524090 APLP2Q06481 763 aa21.84■■□□□ 1.09
MTSS1-216ENST00000524090 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
MTSS1-216ENST00000524090 WDR62O43379 1518 aa21.82■■□□□ 1.08
MTSS1-216ENST00000524090 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
MTSS1-216ENST00000524090 PBRM1Q86U86 1689 aa21.79■■□□□ 1.08
MTSS1-216ENST00000524090 ERCC6Q03468 1493 aa21.73■■□□□ 1.07
MTSS1-216ENST00000524090 IFT140Q96RY7 1462 aa21.72■■□□□ 1.07
MTSS1-216ENST00000524090 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms