RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516517.1

SNORD116-25-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 116-25, humanhuman

BASIC

Gene SNORD116-25, Length 92 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD116-25-201ENST00000516517 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SNORD116-25-201ENST00000516517 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.38■□□□□ 0.05
SNORD116-25-201ENST00000516517 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
SNORD116-25-201ENST00000516517 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
SNORD116-25-201ENST00000516517 FOXD1Q16676 465 aa13.12□□□□□ -0.31
SNORD116-25-201ENST00000516517 POTEDQ86YR6 584 aa12.77□□□□□ -0.37
SNORD116-25-201ENST00000516517 MSH5O43196 834 aa12.5□□□□□ -0.41
SNORD116-25-201ENST00000516517 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
SNORD116-25-201ENST00000516517 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.03□□□□□ -0.48
SNORD116-25-201ENST00000516517 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.95□□□□□ -0.5
SNORD116-25-201ENST00000516517 ADRA2BP18089 450 aa11.91□□□□□ -0.5
SNORD116-25-201ENST00000516517 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.1□□□□□ -0.63
SNORD116-25-201ENST00000516517 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.68□□□□□ -0.7
SNORD116-25-201ENST00000516517 RNF39Q9H2S5 420 aa10.59□□□□□ -0.71
SNORD116-25-201ENST00000516517 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
SNORD116-25-201ENST00000516517 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.46□□□□□ -0.73
SNORD116-25-201ENST00000516517 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SNORD116-25-201ENST00000516517 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.38□□□□□ -0.75
SNORD116-25-201ENST00000516517 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SNORD116-25-201ENST00000516517 DNAJC5BQ9UF47 199 aa10.29□□□□□ -0.76
SNORD116-25-201ENST00000516517 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
SNORD116-25-201ENST00000516517 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SNORD116-25-201ENST00000516517 POTEHQ6S545 545 aa9.95□□□□□ -0.82
SNORD116-25-201ENST00000516517 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SNORD116-25-201ENST00000516517 CAPN15O75808 1086 aa9.78□□□□□ -0.84
SNORD116-25-201ENST00000516517 DSG3P32926 999 aa9.78□□□□□ -0.84
SNORD116-25-201ENST00000516517 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SNORD116-25-201ENST00000516517 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SNORD116-25-201ENST00000516517 APLP2Q06481 763 aa9.57□□□□□ -0.88
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SNORD116-25-201ENST00000516517 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SNORD116-25-201ENST00000516517 ABCB7O75027 752 aa9.49□□□□□ -0.89
SNORD116-25-201ENST00000516517 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SNORD116-25-201ENST00000516517 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SNORD116-25-201ENST00000516517 SLC4A2P04920 1241 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD116-25-201ENST00000516517 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SNORD116-25-201ENST00000516517 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SNORD116-25-201ENST00000516517 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.31□□□□□ -0.92
SNORD116-25-201ENST00000516517 KCNA4P22459 653 aa9.26□□□□□ -0.93
SNORD116-25-201ENST00000516517 POLA2Q14181 598 aa9.17□□□□□ -0.94
SNORD116-25-201ENST00000516517 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SNORD116-25-201ENST00000516517 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
SNORD116-25-201ENST00000516517 AKT1S1Q96B36 256 aa9.09□□□□□ -0.95
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SNORD116-25-201ENST00000516517 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.99□□□□□ -0.97
SNORD116-25-201ENST00000516517 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SNORD116-25-201ENST00000516517 HAX1O00165 279 aa8.95□□□□□ -0.98
SNORD116-25-201ENST00000516517 OSCARQ8IYS5 282 aa8.9□□□□□ -0.98
SNORD116-25-201ENST00000516517 PITPNM1O00562 1244 aa8.88□□□□□ -0.99
SNORD116-25-201ENST00000516517 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
SNORD116-25-201ENST00000516517 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
SNORD116-25-201ENST00000516517 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.81□□□□□ -1
SNORD116-25-201ENST00000516517 EVX2Q03828 476 aa8.73□□□□□ -1.01
SNORD116-25-201ENST00000516517 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SNORD116-25-201ENST00000516517 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.69□□□□□ -1.02
SNORD116-25-201ENST00000516517 SPDYE6P0CI01 402 aa8.69□□□□□ -1.02
SNORD116-25-201ENST00000516517 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.69□□□□□ -1.02
SNORD116-25-201ENST00000516517 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SNORD116-25-201ENST00000516517 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SNORD116-25-201ENST00000516517 FBLN2P98095 1184 aa8.63□□□□□ -1.03
SNORD116-25-201ENST00000516517 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.61□□□□□ -1.03
SNORD116-25-201ENST00000516517 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.61□□□□□ -1.03
SNORD116-25-201ENST00000516517 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.59□□□□□ -1.03
SNORD116-25-201ENST00000516517 LHX8Q68G74 356 aa8.58□□□□□ -1.04
SNORD116-25-201ENST00000516517 GABBR2O75899 941 aa8.57□□□□□ -1.04
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SNORD116-25-201ENST00000516517 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.5□□□□□ -1.05
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZBTB22O15209 634 aa8.48□□□□□ -1.05
SNORD116-25-201ENST00000516517 CHADLQ6NUI6 762 aa8.46□□□□□ -1.06
SNORD116-25-201ENST00000516517 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SNORD116-25-201ENST00000516517 PRR29P0C7W0 189 aa8.43□□□□□ -1.06
SNORD116-25-201ENST00000516517 CLCN6P51797 869 aa8.39□□□□□ -1.07
SNORD116-25-201ENST00000516517 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SNORD116-25-201ENST00000516517 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
SNORD116-25-201ENST00000516517 POTEIP0CG38 1075 aa8.35□□□□□ -1.07
SNORD116-25-201ENST00000516517 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.35□□□□□ -1.07
SNORD116-25-201ENST00000516517 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SNORD116-25-201ENST00000516517 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.3□□□□□ -1.08
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.19□□□□□ -1.1
SNORD116-25-201ENST00000516517 OTUD5Q96G74 571 aa8.13□□□□□ -1.11
SNORD116-25-201ENST00000516517 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SNORD116-25-201ENST00000516517 POTEMA6NI47 508 aa8.1□□□□□ -1.11
SNORD116-25-201ENST00000516517 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
SNORD116-25-201ENST00000516517 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.1□□□□□ -1.11
SNORD116-25-201ENST00000516517 CREBZFQ9NS37 354 aa8.09□□□□□ -1.11
SNORD116-25-201ENST00000516517 POTEGQ6S5H5 508 aa8.07□□□□□ -1.12
SNORD116-25-201ENST00000516517 POTEB2H3BUK9 544 aa8.06□□□□□ -1.12
SNORD116-25-201ENST00000516517 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.04□□□□□ -1.12
SNORD116-25-201ENST00000516517 PHF12Q96QT6 1004 aa8.02□□□□□ -1.13
SNORD116-25-201ENST00000516517 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
SNORD116-25-201ENST00000516517 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.97□□□□□ -1.13
SNORD116-25-201ENST00000516517 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SNORD116-25-201ENST00000516517 METRNQ9UJH8 293 aa7.97□□□□□ -1.13
SNORD116-25-201ENST00000516517 SLC39A7Q92504 469 aa7.96□□□□□ -1.14
SNORD116-25-201ENST00000516517 C7P10643 843 aa7.95□□□□□ -1.14
SNORD116-25-201ENST00000516517 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms