RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492440.1

TTLL3-229, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,549 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-229ENST00000492440 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.6■■■■□ 3.29
TTLL3-229ENST00000492440 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.92■■■□□ 2.54
TTLL3-229ENST00000492440 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
TTLL3-229ENST00000492440 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.53■■■□□ 2.32
TTLL3-229ENST00000492440 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.09■■■□□ 2.25
TTLL3-229ENST00000492440 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.09■■■□□ 2.25
TTLL3-229ENST00000492440 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.09■■■□□ 2.25
TTLL3-229ENST00000492440 ABCC9O60706 1549 aa29.02■■■□□ 2.24
TTLL3-229ENST00000492440 NACADO15069 1562 aa28.74■■■□□ 2.19
TTLL3-229ENST00000492440 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.38■■■□□ 2.13
TTLL3-229ENST00000492440 SCRIBQ14160 1630 aa28.37■■■□□ 2.13
TTLL3-229ENST00000492440 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
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TTLL3-229ENST00000492440 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.71■■■□□ 2.03
TTLL3-229ENST00000492440 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.58■■■□□ 2.01
TTLL3-229ENST00000492440 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.51■■□□□ 1.99
TTLL3-229ENST00000492440 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TTLL3-229ENST00000492440 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.47■■□□□ 1.99
TTLL3-229ENST00000492440 SMARCA4P51532 1647 aa27.28■■□□□ 1.96
TTLL3-229ENST00000492440 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.958e-6■□□□□ 8.9
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TTLL3-229ENST00000492440 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.21■■□□□ 1.95
TTLL3-229ENST00000492440 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
TTLL3-229ENST00000492440 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.01■■□□□ 1.91
TTLL3-229ENST00000492440 SMARCA2P51531 1590 aa26.8■■□□□ 1.88
TTLL3-229ENST00000492440 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.78■■□□□ 1.88
TTLL3-229ENST00000492440 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.73■■□□□ 1.87
TTLL3-229ENST00000492440 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
TTLL3-229ENST00000492440 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TTLL3-229ENST00000492440 HMGXB3Q12766 1538 aa26.53■■□□□ 1.84
TTLL3-229ENST00000492440 NCAPD3P42695 1498 aa26.52■■□□□ 1.84
TTLL3-229ENST00000492440 TRIM41Q8WV44 630 aa26.51■■□□□ 1.83
TTLL3-229ENST00000492440 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.42■■□□□ 1.82
TTLL3-229ENST00000492440 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.3■■□□□ 1.8
TTLL3-229ENST00000492440 ABCC8Q09428 1581 aa26.21■■□□□ 1.79
TTLL3-229ENST00000492440 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
TTLL3-229ENST00000492440 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.08■■□□□ 1.77
TTLL3-229ENST00000492440 CFTRP13569 1480 aa26.01■■□□□ 1.75
TTLL3-229ENST00000492440 EEA1Q15075 1411 aa25.96■■□□□ 1.75
TTLL3-229ENST00000492440 SYNJ1O43426 1573 aa25.94■■□□□ 1.74
TTLL3-229ENST00000492440 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TTLL3-229ENST00000492440 TOP2BQ02880 1626 aa25.85■■□□□ 1.73
TTLL3-229ENST00000492440 PRDM2Q13029 1718 aa25.84■■□□□ 1.73
TTLL3-229ENST00000492440 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.83■■□□□ 1.73
TTLL3-229ENST00000492440 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.82■■□□□ 1.72
TTLL3-229ENST00000492440 SOGA1O94964 1423 aa25.81■■□□□ 1.72
TTLL3-229ENST00000492440 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.68■■□□□ 1.7
TTLL3-229ENST00000492440 CUX1P39880 1505 aa25.68■■□□□ 1.7
TTLL3-229ENST00000492440 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.67■■□□□ 1.7
TTLL3-229ENST00000492440 KIF21BO75037 1637 aa25.56■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 GOLGA3Q08378 1498 aa25.55■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.55■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.54■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.53■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.53■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.47■■□□□ 1.67
TTLL3-229ENST00000492440 KIF27Q86VH2 1401 aa25.42■■□□□ 1.66
TTLL3-229ENST00000492440 NESP48681 1621 aa25.41■■□□□ 1.66
TTLL3-229ENST00000492440 CEP162Q5TB80 1403 aa25.39■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.39■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.35■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.35■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 PRXQ9BXM0 1461 aa25.35■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.34■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TTLL3-229ENST00000492440 TOPBP1Q92547 1522 aa25.3■■□□□ 1.64
TTLL3-229ENST00000492440 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.29■■□□□ 1.64
TTLL3-229ENST00000492440 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TTLL3-229ENST00000492440 CUX2O14529 1486 aa25.24■■□□□ 1.63
TTLL3-229ENST00000492440 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.22■■□□□ 1.63
TTLL3-229ENST00000492440 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TTLL3-229ENST00000492440 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TTLL3-229ENST00000492440 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.19■■□□□ 1.62
TTLL3-229ENST00000492440 IGF1RP08069 1367 aa25.13■■□□□ 1.61
TTLL3-229ENST00000492440 CLIP1P30622 1438 aa25.13■■□□□ 1.61
TTLL3-229ENST00000492440 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.11■■□□□ 1.61
TTLL3-229ENST00000492440 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.06■■□□□ 1.6
TTLL3-229ENST00000492440 WDR97A6NE52 1622 aa25.04■■□□□ 1.6
TTLL3-229ENST00000492440 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.01■■□□□ 1.59
TTLL3-229ENST00000492440 MRC2Q9UBG0 1479 aa25■■□□□ 1.59
TTLL3-229ENST00000492440 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.99■■□□□ 1.59
TTLL3-229ENST00000492440 ERCC6Q03468 1493 aa24.97■■□□□ 1.59
TTLL3-229ENST00000492440 CUL7Q14999 1698 aa24.94■■□□□ 1.58
TTLL3-229ENST00000492440 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.93■■□□□ 1.58
TTLL3-229ENST00000492440 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
TTLL3-229ENST00000492440 WDR62O43379 1518 aa24.86■■□□□ 1.57
TTLL3-229ENST00000492440 HRCP23327 699 aa24.85■■□□□ 1.57
TTLL3-229ENST00000492440 ARAP1Q96P48 1450 aa24.85■■□□□ 1.57
TTLL3-229ENST00000492440 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.84■■□□□ 1.57
TTLL3-229ENST00000492440 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TTLL3-229ENST00000492440 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TTLL3-229ENST00000492440 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.78■■□□□ 1.56
TTLL3-229ENST00000492440 IFT140Q96RY7 1462 aa24.76■■□□□ 1.55
TTLL3-229ENST00000492440 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-229ENST00000492440 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TTLL3-229ENST00000492440 APLP2Q06481 763 aa24.66■■□□□ 1.54
TTLL3-229ENST00000492440 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.65■■□□□ 1.54
TTLL3-229ENST00000492440 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.65■■□□□ 1.54
TTLL3-229ENST00000492440 PBRM1Q86U86 1689 aa24.64■■□□□ 1.53
TTLL3-229ENST00000492440 GRIN2BQ13224 1484 aa24.63■■□□□ 1.53
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