RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449938.6

USP36-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,647 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-202ENST00000449938 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.57■■■□□ 2.32
USP36-202ENST00000449938 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.66■■□□□ 1.7
USP36-202ENST00000449938 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
USP36-202ENST00000449938 ABCC9O60706 1549 aa24.55■■□□□ 1.52
USP36-202ENST00000449938 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.49■■□□□ 1.51
USP36-202ENST00000449938 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-202ENST00000449938 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.25■■□□□ 1.47
USP36-202ENST00000449938 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.1■■□□□ 1.45
USP36-202ENST00000449938 NACADO15069 1562 aa23.84■■□□□ 1.41
USP36-202ENST00000449938 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.74■■□□□ 1.39
USP36-202ENST00000449938 SCRIBQ14160 1630 aa23.58■■□□□ 1.37
USP36-202ENST00000449938 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
USP36-202ENST00000449938 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.36■■□□□ 1.33
USP36-202ENST00000449938 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.09■■□□□ 1.29
USP36-202ENST00000449938 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
USP36-202ENST00000449938 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
USP36-202ENST00000449938 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.9■■□□□ 1.26
USP36-202ENST00000449938 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
USP36-202ENST00000449938 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.82■■□□□ 1.24
USP36-202ENST00000449938 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.68■■□□□ 1.22
USP36-202ENST00000449938 SMARCA4P51532 1647 aa22.65■■□□□ 1.22
USP36-202ENST00000449938 WIZO95785 1651 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-202ENST00000449938 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
USP36-202ENST00000449938 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP36-202ENST00000449938 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.4■■□□□ 1.18
USP36-202ENST00000449938 SMARCA2P51531 1590 aa22.24■■□□□ 1.15
USP36-202ENST00000449938 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.23■■□□□ 1.15
USP36-202ENST00000449938 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.22■■□□□ 1.15
USP36-202ENST00000449938 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.21■■□□□ 1.15
USP36-202ENST00000449938 TRIM41Q8WV44 630 aa22.13■■□□□ 1.13
USP36-202ENST00000449938 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.12■■□□□ 1.13
USP36-202ENST00000449938 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP36-202ENST00000449938 HMGXB3Q12766 1538 aa22■■□□□ 1.11
USP36-202ENST00000449938 NCAPD3P42695 1498 aa21.99■■□□□ 1.11
USP36-202ENST00000449938 ABCC8Q09428 1581 aa21.8■■□□□ 1.08
USP36-202ENST00000449938 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.77■■□□□ 1.08
USP36-202ENST00000449938 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
USP36-202ENST00000449938 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
USP36-202ENST00000449938 EEA1Q15075 1411 aa21.6■■□□□ 1.05
USP36-202ENST00000449938 CFTRP13569 1480 aa21.58■■□□□ 1.05
USP36-202ENST00000449938 SYNJ1O43426 1573 aa21.55■■□□□ 1.04
USP36-202ENST00000449938 TOP2BQ02880 1626 aa21.48■■□□□ 1.03
USP36-202ENST00000449938 SOGA1O94964 1423 aa21.47■■□□□ 1.03
USP36-202ENST00000449938 PRDM2Q13029 1718 aa21.47■■□□□ 1.03
USP36-202ENST00000449938 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.45■■□□□ 1.02
USP36-202ENST00000449938 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.45■■□□□ 1.02
USP36-202ENST00000449938 NESP48681 1621 aa21.4■■□□□ 1.02
USP36-202ENST00000449938 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.4■■□□□ 1.02
USP36-202ENST00000449938 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.35■■□□□ 1.01
USP36-202ENST00000449938 CUX1P39880 1505 aa21.33■■□□□ 1.01
USP36-202ENST00000449938 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.33■■□□□ 1
USP36-202ENST00000449938 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.29■■□□□ 1
USP36-202ENST00000449938 GOLGA3Q08378 1498 aa21.28■■□□□ 1
USP36-202ENST00000449938 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.27■□□□□ 0.99
USP36-202ENST00000449938 KIF21BO75037 1637 aa21.26■□□□□ 0.99
USP36-202ENST00000449938 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.26■□□□□ 0.99
USP36-202ENST00000449938 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.2■□□□□ 0.98
USP36-202ENST00000449938 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.2■□□□□ 0.98
USP36-202ENST00000449938 CEP162Q5TB80 1403 aa21.15■□□□□ 0.98
USP36-202ENST00000449938 KIF27Q86VH2 1401 aa21.14■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.12■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.11■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.08■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.08■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 ERCC6Q03468 1493 aa21.07■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.06■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 PRXQ9BXM0 1461 aa21.05■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.04■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.02■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 TOPBP1Q92547 1522 aa21■□□□□ 0.95
USP36-202ENST00000449938 CUX2O14529 1486 aa20.98■□□□□ 0.95
USP36-202ENST00000449938 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
USP36-202ENST00000449938 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.94■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 CLIP1P30622 1438 aa20.93■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.91■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 IGF1RP08069 1367 aa20.9■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 WDR62O43379 1518 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-202ENST00000449938 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.82■□□□□ 0.92
USP36-202ENST00000449938 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.8■□□□□ 0.92
USP36-202ENST00000449938 HRCP23327 699 aa20.8■□□□□ 0.92
USP36-202ENST00000449938 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.79■□□□□ 0.92
USP36-202ENST00000449938 WDR97A6NE52 1622 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-202ENST00000449938 CUL7Q14999 1698 aa20.73■□□□□ 0.91
USP36-202ENST00000449938 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
USP36-202ENST00000449938 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.68■□□□□ 0.9
USP36-202ENST00000449938 ARAP1Q96P48 1450 aa20.67■□□□□ 0.9
USP36-202ENST00000449938 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
USP36-202ENST00000449938 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.64■□□□□ 0.89
USP36-202ENST00000449938 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
USP36-202ENST00000449938 APLP2Q06481 763 aa20.63■□□□□ 0.89
USP36-202ENST00000449938 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.6■□□□□ 0.89
USP36-202ENST00000449938 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
USP36-202ENST00000449938 IFT140Q96RY7 1462 aa20.57■□□□□ 0.88
USP36-202ENST00000449938 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP36-202ENST00000449938 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.51■□□□□ 0.87
USP36-202ENST00000449938 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms