RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436901.2

KLF3-AS1-201, KLF3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene KLF3-AS1, Length 1,896 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3-AS1-201ENST00000436901 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.87■■■■■ 5.41
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.41■■■■■ 4.38
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
KLF3-AS1-201ENST00000436901 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.41■■■■■ 4.06
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.26■■■■■ 4.04
KLF3-AS1-201ENST00000436901 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.22■■■■■ 4.03
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.72■■■■□ 3.95
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ABCC9O60706 1549 aa39.59■■■■□ 3.93
KLF3-AS1-201ENST00000436901 NACADO15069 1562 aa39.35■■■■□ 3.89
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SCRIBQ14160 1630 aa39.08■■■■□ 3.85
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.9■■■■□ 3.82
KLF3-AS1-201ENST00000436901 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.19■■■■□ 3.7
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.1■■■■□ 3.69
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.92■■■■□ 3.66
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.77■■■■□ 3.64
KLF3-AS1-201ENST00000436901 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
KLF3-AS1-201ENST00000436901 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.69■■■■□ 3.62
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.61■■■■□ 3.61
KLF3-AS1-201ENST00000436901 WIZO95785 1651 aa37.54■■■■□ 3.6
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SMARCA4P51532 1647 aa37.49■■■■□ 3.59
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.43■■■■□ 3.58
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.98■■■■□ 3.51
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SMARCA2P51531 1590 aa36.82■■■■□ 3.48
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.76■■■■□ 3.48
KLF3-AS1-201ENST00000436901 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.7■■■■□ 3.46
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TRIM41Q8WV44 630 aa36.65■■■■□ 3.46
KLF3-AS1-201ENST00000436901 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
KLF3-AS1-201ENST00000436901 HMGXB3Q12766 1538 aa36.31■■■■□ 3.4
KLF3-AS1-201ENST00000436901 NCAPD3P42695 1498 aa36.28■■■■□ 3.4
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.19■■■■□ 3.38
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ABCC8Q09428 1581 aa36.18■■■■□ 3.38
KLF3-AS1-201ENST00000436901 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
KLF3-AS1-201ENST00000436901 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.88■■■■□ 3.33
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.86■■■■□ 3.33
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SYNJ1O43426 1573 aa35.71■■■■□ 3.31
KLF3-AS1-201ENST00000436901 EEA1Q15075 1411 aa35.67■■■■□ 3.3
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CFTRP13569 1480 aa35.63■■■■□ 3.29
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PRDM2Q13029 1718 aa35.6■■■■□ 3.29
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SOGA1O94964 1423 aa35.59■■■■□ 3.29
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TOP2BQ02880 1626 aa35.54■■■■□ 3.28
KLF3-AS1-201ENST00000436901 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.51■■■■□ 3.28
KLF3-AS1-201ENST00000436901 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.48■■■■□ 3.27
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.42■■■■□ 3.26
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.4■■■■□ 3.26
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.4■■■■□ 3.26
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CUX1P39880 1505 aa35.29■■■■□ 3.24
KLF3-AS1-201ENST00000436901 GOLGA3Q08378 1498 aa35.2■■■■□ 3.23
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KIF21BO75037 1637 aa35.19■■■■□ 3.22
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.18■■■■□ 3.22
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.15■■■■□ 3.22
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.14■■■■□ 3.22
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CEP162Q5TB80 1403 aa35.03■■■■□ 3.2
KLF3-AS1-201ENST00000436901 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
KLF3-AS1-201ENST00000436901 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.03■■■■□ 3.2
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35■■■■□ 3.19
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KIF27Q86VH2 1401 aa34.93■■■■□ 3.18
KLF3-AS1-201ENST00000436901 NESP48681 1621 aa34.92■■■■□ 3.18
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.85■■■■□ 3.17
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.84■■■■□ 3.17
KLF3-AS1-201ENST00000436901 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.83■■■■□ 3.17
KLF3-AS1-201ENST00000436901 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.83■■■■□ 3.17
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PRXQ9BXM0 1461 aa34.8■■■■□ 3.16
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CUX2O14529 1486 aa34.72■■■■□ 3.15
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TOPBP1Q92547 1522 aa34.71■■■■□ 3.15
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.7■■■■□ 3.15
KLF3-AS1-201ENST00000436901 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.69■■■■□ 3.14
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CLIP1P30622 1438 aa34.64■■■■□ 3.14
KLF3-AS1-201ENST00000436901 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.57■■■■□ 3.12
KLF3-AS1-201ENST00000436901 HRCP23327 699 aa34.56■■■■□ 3.12
KLF3-AS1-201ENST00000436901 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.53■■■■□ 3.12
KLF3-AS1-201ENST00000436901 IGF1RP08069 1367 aa34.52■■■■□ 3.12
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.47■■■■□ 3.11
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
KLF3-AS1-201ENST00000436901 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.42■■■■□ 3.1
KLF3-AS1-201ENST00000436901 WDR97A6NE52 1622 aa34.41■■■■□ 3.1
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.38■■■■□ 3.09
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CUL7Q14999 1698 aa34.29■■■■□ 3.08
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.23■■■■□ 3.07
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ARAP1Q96P48 1450 aa34.22■■■■□ 3.07
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.22■■■■□ 3.07
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
KLF3-AS1-201ENST00000436901 APLP2Q06481 763 aa34.14■■■■□ 3.06
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.12■■■■□ 3.05
KLF3-AS1-201ENST00000436901 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.12■■■■□ 3.05
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.03■■■■□ 3.04
KLF3-AS1-201ENST00000436901 WDR62O43379 1518 aa34.03■■■■□ 3.04
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PBRM1Q86U86 1689 aa33.95■■■■□ 3.03
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ERCC6Q03468 1493 aa33.92■■■■□ 3.02
KLF3-AS1-201ENST00000436901 IFT140Q96RY7 1462 aa33.89■■■■□ 3.02
KLF3-AS1-201ENST00000436901 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.87■■■■□ 3.01
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