RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.83■■■□□ 2.21
C9orf172-201ENST00000436881 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.18■■■□□ 2.1
C9orf172-201ENST00000436881 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
C9orf172-201ENST00000436881 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.8■■□□□ 1.88
C9orf172-201ENST00000436881 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.6■■□□□ 1.69
C9orf172-201ENST00000436881 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.35■■□□□ 1.65
C9orf172-201ENST00000436881 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
C9orf172-201ENST00000436881 APLP2Q06481 763 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf172-201ENST00000436881 TRIM41Q8WV44 630 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf172-201ENST00000436881 HRCP23327 699 aa25■■□□□ 1.59
C9orf172-201ENST00000436881 ABCC9O60706 1549 aa24.9■■□□□ 1.58
C9orf172-201ENST00000436881 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.81■■□□□ 1.56
C9orf172-201ENST00000436881 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
C9orf172-201ENST00000436881 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
C9orf172-201ENST00000436881 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
C9orf172-201ENST00000436881 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
C9orf172-201ENST00000436881 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
C9orf172-201ENST00000436881 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.5■■□□□ 1.51
C9orf172-201ENST00000436881 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
C9orf172-201ENST00000436881 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
C9orf172-201ENST00000436881 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
C9orf172-201ENST00000436881 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
C9orf172-201ENST00000436881 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
C9orf172-201ENST00000436881 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
C9orf172-201ENST00000436881 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
C9orf172-201ENST00000436881 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.98■■□□□ 1.43
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.94■■□□□ 1.42
C9orf172-201ENST00000436881 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.73■■□□□ 1.39
C9orf172-201ENST00000436881 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
C9orf172-201ENST00000436881 ITGAEP38570 1179 aa23.63■■□□□ 1.37
C9orf172-201ENST00000436881 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
C9orf172-201ENST00000436881 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
C9orf172-201ENST00000436881 SCRIBQ14160 1630 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf172-201ENST00000436881 NEFLP07196 543 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf172-201ENST00000436881 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
C9orf172-201ENST00000436881 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf172-201ENST00000436881 MYT1Q01538 1121 aa23.27■■□□□ 1.32
C9orf172-201ENST00000436881 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf172-201ENST00000436881 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
C9orf172-201ENST00000436881 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
C9orf172-201ENST00000436881 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
C9orf172-201ENST00000436881 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.13■■□□□ 1.29
C9orf172-201ENST00000436881 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf172-201ENST00000436881 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
C9orf172-201ENST00000436881 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.02■■□□□ 1.28
C9orf172-201ENST00000436881 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.01■■□□□ 1.27
C9orf172-201ENST00000436881 NEUROD1Q13562 356 aa23■■□□□ 1.27
C9orf172-201ENST00000436881 NACADO15069 1562 aa22.98■■□□□ 1.27
C9orf172-201ENST00000436881 FBLN2P98095 1184 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
C9orf172-201ENST00000436881 TRIM52Q96A61 297 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf172-201ENST00000436881 P3H3Q8IVL6 736 aa22.87■■□□□ 1.25
C9orf172-201ENST00000436881 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
C9orf172-201ENST00000436881 EEA1Q15075 1411 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf172-201ENST00000436881 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
C9orf172-201ENST00000436881 ANP32CO43423 234 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf172-201ENST00000436881 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
C9orf172-201ENST00000436881 ARID3CA6NKF2 412 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf172-201ENST00000436881 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.57■■□□□ 1.2
C9orf172-201ENST00000436881 CLIP1P30622 1438 aa22.57■■□□□ 1.2
C9orf172-201ENST00000436881 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
C9orf172-201ENST00000436881 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
C9orf172-201ENST00000436881 MIER1Q8N108 512 aa22.5■■□□□ 1.19
C9orf172-201ENST00000436881 GOLGA3Q08378 1498 aa22.49■■□□□ 1.19
C9orf172-201ENST00000436881 CEP162Q5TB80 1403 aa22.47■■□□□ 1.19
C9orf172-201ENST00000436881 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
C9orf172-201ENST00000436881 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.42■■□□□ 1.18
C9orf172-201ENST00000436881 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
C9orf172-201ENST00000436881 BCANQ96GW7 911 aa22.36■■□□□ 1.17
C9orf172-201ENST00000436881 TONSLQ96HA7 1378 aa22.35■■□□□ 1.17
C9orf172-201ENST00000436881 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.33■■□□□ 1.17
C9orf172-201ENST00000436881 KIF27Q86VH2 1401 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf172-201ENST00000436881 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf172-201ENST00000436881 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf172-201ENST00000436881 ERCC6Q03468 1493 aa22.21■■□□□ 1.15
C9orf172-201ENST00000436881 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.21■■□□□ 1.15
C9orf172-201ENST00000436881 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
C9orf172-201ENST00000436881 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf172-201ENST00000436881 SOGA1O94964 1423 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf172-201ENST00000436881 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf172-201ENST00000436881 TSPY4P0CV99 314 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf172-201ENST00000436881 TSPY10P0CW01 314 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf172-201ENST00000436881 ABCC8Q09428 1581 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf172-201ENST00000436881 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
C9orf172-201ENST00000436881 FKBP8Q14318 412 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf172-201ENST00000436881 SMARCA2P51531 1590 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf172-201ENST00000436881 WIZO95785 1651 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf172-201ENST00000436881 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf172-201ENST00000436881 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf172-201ENST00000436881 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
C9orf172-201ENST00000436881 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 CUX2O14529 1486 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.91■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
C9orf172-201ENST00000436881 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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