RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429313.1

ABCD1P2-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 1 pseudogene 2, humanhuman

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Gene ABCD1P2, Length 1,601 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P2-201ENST00000429313 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.83■■■□□ 2.53
ABCD1P2-201ENST00000429313 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.7■■□□□ 1.86
ABCD1P2-201ENST00000429313 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ABCD1P2-201ENST00000429313 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.58■■□□□ 1.69
ABCD1P2-201ENST00000429313 ABCC9O60706 1549 aa25.39■■□□□ 1.66
ABCD1P2-201ENST00000429313 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.27■■□□□ 1.64
ABCD1P2-201ENST00000429313 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.19■■□□□ 1.62
ABCD1P2-201ENST00000429313 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.16■■□□□ 1.62
ABCD1P2-201ENST00000429313 NACADO15069 1562 aa24.8■■□□□ 1.56
ABCD1P2-201ENST00000429313 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P2-201ENST00000429313 SCRIBQ14160 1630 aa24.51■■□□□ 1.51
ABCD1P2-201ENST00000429313 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P2-201ENST00000429313 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P2-201ENST00000429313 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P2-201ENST00000429313 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.85■■□□□ 1.41
ABCD1P2-201ENST00000429313 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.84■■□□□ 1.41
ABCD1P2-201ENST00000429313 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P2-201ENST00000429313 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P2-201ENST00000429313 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.78■■□□□ 1.4
ABCD1P2-201ENST00000429313 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P2-201ENST00000429313 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P2-201ENST00000429313 SMARCA4P51532 1647 aa23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P2-201ENST00000429313 WIZO95785 1651 aa23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P2-201ENST00000429313 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P2-201ENST00000429313 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P2-201ENST00000429313 SMARCA2P51531 1590 aa23.18■■□□□ 1.3
ABCD1P2-201ENST00000429313 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P2-201ENST00000429313 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P2-201ENST00000429313 TRIM41Q8WV44 630 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD1P2-201ENST00000429313 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD1P2-201ENST00000429313 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P2-201ENST00000429313 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P2-201ENST00000429313 NCAPD3P42695 1498 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P2-201ENST00000429313 HMGXB3Q12766 1538 aa22.89■■□□□ 1.26
ABCD1P2-201ENST00000429313 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P2-201ENST00000429313 ABCC8Q09428 1581 aa22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P2-201ENST00000429313 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P2-201ENST00000429313 EEA1Q15075 1411 aa22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P2-201ENST00000429313 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P2-201ENST00000429313 CFTRP13569 1480 aa22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P2-201ENST00000429313 SYNJ1O43426 1573 aa22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P2-201ENST00000429313 SOGA1O94964 1423 aa22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P2-201ENST00000429313 TOP2BQ02880 1626 aa22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P2-201ENST00000429313 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P2-201ENST00000429313 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P2-201ENST00000429313 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P2-201ENST00000429313 PRDM2Q13029 1718 aa22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P2-201ENST00000429313 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P2-201ENST00000429313 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P2-201ENST00000429313 GOLGA3Q08378 1498 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P2-201ENST00000429313 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P2-201ENST00000429313 KIF21BO75037 1637 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P2-201ENST00000429313 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P2-201ENST00000429313 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P2-201ENST00000429313 CUX1P39880 1505 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P2-201ENST00000429313 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P2-201ENST00000429313 CEP162Q5TB80 1403 aa22.14■■□□□ 1.14
ABCD1P2-201ENST00000429313 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P2-201ENST00000429313 KIF27Q86VH2 1401 aa22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P2-201ENST00000429313 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P2-201ENST00000429313 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P2-201ENST00000429313 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P2-201ENST00000429313 PRXQ9BXM0 1461 aa22.02■■□□□ 1.11
ABCD1P2-201ENST00000429313 HRCP23327 699 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P2-201ENST00000429313 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.97■■□□□ 1.11
ABCD1P2-201ENST00000429313 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.95■■□□□ 1.1
ABCD1P2-201ENST00000429313 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.93■■□□□ 1.1
ABCD1P2-201ENST00000429313 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.92■■□□□ 1.1
ABCD1P2-201ENST00000429313 ERCC6Q03468 1493 aa21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P2-201ENST00000429313 CUX2O14529 1486 aa21.89■■□□□ 1.1
ABCD1P2-201ENST00000429313 CLIP1P30622 1438 aa21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P2-201ENST00000429313 NESP48681 1621 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P2-201ENST00000429313 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P2-201ENST00000429313 TOPBP1Q92547 1522 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD1P2-201ENST00000429313 IGF1RP08069 1367 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P2-201ENST00000429313 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P2-201ENST00000429313 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P2-201ENST00000429313 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P2-201ENST00000429313 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P2-201ENST00000429313 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P2-201ENST00000429313 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.65■■□□□ 1.06
ABCD1P2-201ENST00000429313 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P2-201ENST00000429313 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P2-201ENST00000429313 WDR97A6NE52 1622 aa21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P2-201ENST00000429313 CUL7Q14999 1698 aa21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P2-201ENST00000429313 ARAP1Q96P48 1450 aa21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P2-201ENST00000429313 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.6■■□□□ 1.05
ABCD1P2-201ENST00000429313 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ABCD1P2-201ENST00000429313 APLP2Q06481 763 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD1P2-201ENST00000429313 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD1P2-201ENST00000429313 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD1P2-201ENST00000429313 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD1P2-201ENST00000429313 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P2-201ENST00000429313 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P2-201ENST00000429313 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P2-201ENST00000429313 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ABCD1P2-201ENST00000429313 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P2-201ENST00000429313 WDR62O43379 1518 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD1P2-201ENST00000429313 MAP3K1Q13233 1512 aa21.39■■□□□ 1.02
ABCD1P2-201ENST00000429313 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.37■■□□□ 1.01
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