RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424076.7

MEG3-207, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 5

Gene MEG3, Length 2,672 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-207ENST00000424076 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.72■■■□□ 2.51
MEG3-207ENST00000424076 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.32■■□□□ 1.8
MEG3-207ENST00000424076 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
MEG3-207ENST00000424076 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.89■■□□□ 1.73
MEG3-207ENST00000424076 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.5■■□□□ 1.67
MEG3-207ENST00000424076 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.22■■□□□ 1.63
MEG3-207ENST00000424076 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
MEG3-207ENST00000424076 ABCC9O60706 1549 aa24.65■■□□□ 1.54
MEG3-207ENST00000424076 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.63■■□□□ 1.53
MEG3-207ENST00000424076 SCRIBQ14160 1630 aa24.59■■□□□ 1.53
MEG3-207ENST00000424076 NACADO15069 1562 aa24.39■■□□□ 1.5
MEG3-207ENST00000424076 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.35■■□□□ 1.49
MEG3-207ENST00000424076 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
MEG3-207ENST00000424076 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.07■■□□□ 1.44
MEG3-207ENST00000424076 CECR2Q9BXF3 1484 aa24■■□□□ 1.43
MEG3-207ENST00000424076 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.88■■□□□ 1.41
MEG3-207ENST00000424076 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.77■■□□□ 1.4
MEG3-207ENST00000424076 WIZO95785 1651 aa23.74■■□□□ 1.39
MEG3-207ENST00000424076 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
MEG3-207ENST00000424076 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.6■■□□□ 1.37
MEG3-207ENST00000424076 TRIM41Q8WV44 630 aa23.49■■□□□ 1.35
MEG3-207ENST00000424076 SMARCA4P51532 1647 aa23.49■■□□□ 1.35
MEG3-207ENST00000424076 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
MEG3-207ENST00000424076 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.46■■□□□ 1.35
MEG3-207ENST00000424076 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
MEG3-207ENST00000424076 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
MEG3-207ENST00000424076 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
MEG3-207ENST00000424076 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.23■■□□□ 1.31
MEG3-207ENST00000424076 SMARCA2P51531 1590 aa23.22■■□□□ 1.31
MEG3-207ENST00000424076 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.19■■□□□ 1.3
MEG3-207ENST00000424076 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.09■■□□□ 1.29
MEG3-207ENST00000424076 ABCC8Q09428 1581 aa23.07■■□□□ 1.28
MEG3-207ENST00000424076 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.06■■□□□ 1.28
MEG3-207ENST00000424076 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.96■■□□□ 1.27
MEG3-207ENST00000424076 HRCP23327 699 aa22.93■■□□□ 1.26
MEG3-207ENST00000424076 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
MEG3-207ENST00000424076 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
MEG3-207ENST00000424076 SOGA1O94964 1423 aa22.76■■□□□ 1.23
MEG3-207ENST00000424076 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
MEG3-207ENST00000424076 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.69■■□□□ 1.22
MEG3-207ENST00000424076 SYNJ1O43426 1573 aa22.64■■□□□ 1.21
MEG3-207ENST00000424076 NCAPD3P42695 1498 aa22.57■■□□□ 1.2
MEG3-207ENST00000424076 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.57■■□□□ 1.2
MEG3-207ENST00000424076 EEA1Q15075 1411 aa22.56■■□□□ 1.2
MEG3-207ENST00000424076 HMGXB3Q12766 1538 aa22.55■■□□□ 1.2
MEG3-207ENST00000424076 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
MEG3-207ENST00000424076 CEP162Q5TB80 1403 aa22.47■■□□□ 1.19
MEG3-207ENST00000424076 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.46■■□□□ 1.19
MEG3-207ENST00000424076 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
MEG3-207ENST00000424076 GOLGA3Q08378 1498 aa22.4■■□□□ 1.18
MEG3-207ENST00000424076 TOP2BQ02880 1626 aa22.38■■□□□ 1.17
MEG3-207ENST00000424076 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.32■■□□□ 1.16
MEG3-207ENST00000424076 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.31■■□□□ 1.16
MEG3-207ENST00000424076 KIF21BO75037 1637 aa22.31■■□□□ 1.16
MEG3-207ENST00000424076 CFTRP13569 1480 aa22.29■■□□□ 1.16
MEG3-207ENST00000424076 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
MEG3-207ENST00000424076 CUX1P39880 1505 aa22.25■■□□□ 1.15
MEG3-207ENST00000424076 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.23■■□□□ 1.15
MEG3-207ENST00000424076 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.22■■□□□ 1.15
MEG3-207ENST00000424076 PRDM2Q13029 1718 aa22.13■■□□□ 1.13
MEG3-207ENST00000424076 CLIP1P30622 1438 aa22.12■■□□□ 1.13
MEG3-207ENST00000424076 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MEG3-207ENST00000424076 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.1■■□□□ 1.13
MEG3-207ENST00000424076 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
MEG3-207ENST00000424076 PRXQ9BXM0 1461 aa22.05■■□□□ 1.12
MEG3-207ENST00000424076 KIF27Q86VH2 1401 aa22.02■■□□□ 1.12
MEG3-207ENST00000424076 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
MEG3-207ENST00000424076 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.01■■□□□ 1.11
MEG3-207ENST00000424076 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.99■■□□□ 1.11
MEG3-207ENST00000424076 CUX2O14529 1486 aa21.9■■□□□ 1.1
MEG3-207ENST00000424076 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.9■■□□□ 1.1
MEG3-207ENST00000424076 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
MEG3-207ENST00000424076 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.89■■□□□ 1.1
MEG3-207ENST00000424076 NESP48681 1621 aa21.88■■□□□ 1.09
MEG3-207ENST00000424076 ARAP1Q96P48 1450 aa21.84■■□□□ 1.09
MEG3-207ENST00000424076 IGF1RP08069 1367 aa21.83■■□□□ 1.09
MEG3-207ENST00000424076 APLP2Q06481 763 aa21.81■■□□□ 1.08
MEG3-207ENST00000424076 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.77■■□□□ 1.08
MEG3-207ENST00000424076 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.74■■□□□ 1.07
MEG3-207ENST00000424076 TOPBP1Q92547 1522 aa21.73■■□□□ 1.07
MEG3-207ENST00000424076 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.73■■□□□ 1.07
MEG3-207ENST00000424076 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.72■■□□□ 1.07
MEG3-207ENST00000424076 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.72■■□□□ 1.07
MEG3-207ENST00000424076 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
MEG3-207ENST00000424076 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
MEG3-207ENST00000424076 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.67■■□□□ 1.06
MEG3-207ENST00000424076 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
MEG3-207ENST00000424076 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.63■■□□□ 1.05
MEG3-207ENST00000424076 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
MEG3-207ENST00000424076 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.52■■□□□ 1.03
MEG3-207ENST00000424076 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.51■■□□□ 1.03
MEG3-207ENST00000424076 WDR97A6NE52 1622 aa21.5■■□□□ 1.03
MEG3-207ENST00000424076 P3H3Q8IVL6 736 aa21.47■■□□□ 1.03
MEG3-207ENST00000424076 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
MEG3-207ENST00000424076 CUL7Q14999 1698 aa21.46■■□□□ 1.03
MEG3-207ENST00000424076 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
MEG3-207ENST00000424076 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.42■■□□□ 1.02
MEG3-207ENST00000424076 TIAM1Q13009 1591 aa21.41■■□□□ 1.02
MEG3-207ENST00000424076 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.39■■□□□ 1.01
MEG3-207ENST00000424076 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.38■■□□□ 1.01
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