RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423456.5

MEG3-206, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MEG3, Length 1,771 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-206ENST00000423456 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.2■■■■□ 3.55
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MEG3-206ENST00000423456 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
MEG3-206ENST00000423456 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.78■■■□□ 2.52
MEG3-206ENST00000423456 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.59■■■□□ 2.49
MEG3-206ENST00000423456 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.52■■■□□ 2.48
MEG3-206ENST00000423456 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.26■■■□□ 2.43
MEG3-206ENST00000423456 ABCC9O60706 1549 aa30.08■■■□□ 2.41
MEG3-206ENST00000423456 NACADO15069 1562 aa29.91■■■□□ 2.38
MEG3-206ENST00000423456 SCRIBQ14160 1630 aa29.66■■■□□ 2.34
MEG3-206ENST00000423456 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
MEG3-206ENST00000423456 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.53■■■□□ 2.32
MEG3-206ENST00000423456 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
MEG3-206ENST00000423456 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.97■■■□□ 2.23
MEG3-206ENST00000423456 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.9■■■□□ 2.22
MEG3-206ENST00000423456 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.76■■■□□ 2.19
MEG3-206ENST00000423456 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.7■■■□□ 2.18
MEG3-206ENST00000423456 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.67■■■□□ 2.18
MEG3-206ENST00000423456 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
MEG3-206ENST00000423456 WIZO95785 1651 aa28.53■■■□□ 2.16
MEG3-206ENST00000423456 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.15
MEG3-206ENST00000423456 SMARCA4P51532 1647 aa28.48■■■□□ 2.15
MEG3-206ENST00000423456 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
MEG3-206ENST00000423456 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.16■■■□□ 2.1
MEG3-206ENST00000423456 SMARCA2P51531 1590 aa28■■■□□ 2.07
MEG3-206ENST00000423456 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.99■■■□□ 2.07
MEG3-206ENST00000423456 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
MEG3-206ENST00000423456 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.95■■■□□ 2.06
MEG3-206ENST00000423456 TRIM41Q8WV44 630 aa27.85■■■□□ 2.05
MEG3-206ENST00000423456 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
MEG3-206ENST00000423456 NCAPD3P42695 1498 aa27.64■■■□□ 2.02
MEG3-206ENST00000423456 HMGXB3Q12766 1538 aa27.6■■■□□ 2.01
MEG3-206ENST00000423456 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.57■■■□□ 2
MEG3-206ENST00000423456 ABCC8Q09428 1581 aa27.5■■□□□ 1.99
MEG3-206ENST00000423456 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
MEG3-206ENST00000423456 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
MEG3-206ENST00000423456 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.24■■□□□ 1.95
MEG3-206ENST00000423456 SYNJ1O43426 1573 aa27.16■■□□□ 1.94
MEG3-206ENST00000423456 CFTRP13569 1480 aa27.14■■□□□ 1.94
MEG3-206ENST00000423456 EEA1Q15075 1411 aa27.12■■□□□ 1.93
MEG3-206ENST00000423456 SOGA1O94964 1423 aa27.1■■□□□ 1.93
MEG3-206ENST00000423456 TOP2BQ02880 1626 aa27.02■■□□□ 1.92
MEG3-206ENST00000423456 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.99■■□□□ 1.91
MEG3-206ENST00000423456 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.97■■□□□ 1.91
MEG3-206ENST00000423456 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.96■■□□□ 1.91
MEG3-206ENST00000423456 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.95■■□□□ 1.9
MEG3-206ENST00000423456 PRDM2Q13029 1718 aa26.95■■□□□ 1.9
MEG3-206ENST00000423456 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.91■■□□□ 1.9
MEG3-206ENST00000423456 CUX1P39880 1505 aa26.86■■□□□ 1.89
MEG3-206ENST00000423456 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.78■■□□□ 1.88
MEG3-206ENST00000423456 GOLGA3Q08378 1498 aa26.75■■□□□ 1.87
MEG3-206ENST00000423456 KIF21BO75037 1637 aa26.73■■□□□ 1.87
MEG3-206ENST00000423456 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.71■■□□□ 1.87
MEG3-206ENST00000423456 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.7■■□□□ 1.86
MEG3-206ENST00000423456 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.63■■□□□ 1.85
MEG3-206ENST00000423456 CEP162Q5TB80 1403 aa26.63■■□□□ 1.85
MEG3-206ENST00000423456 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.63■■□□□ 1.85
MEG3-206ENST00000423456 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
MEG3-206ENST00000423456 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.59■■□□□ 1.85
MEG3-206ENST00000423456 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
MEG3-206ENST00000423456 NESP48681 1621 aa26.57■■□□□ 1.84
MEG3-206ENST00000423456 KIF27Q86VH2 1401 aa26.54■■□□□ 1.84
MEG3-206ENST00000423456 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.53■■□□□ 1.84
MEG3-206ENST00000423456 PRXQ9BXM0 1461 aa26.52■■□□□ 1.84
MEG3-206ENST00000423456 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.48■■□□□ 1.83
MEG3-206ENST00000423456 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.48■■□□□ 1.83
MEG3-206ENST00000423456 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.46■■□□□ 1.83
MEG3-206ENST00000423456 TOPBP1Q92547 1522 aa26.4■■□□□ 1.82
MEG3-206ENST00000423456 CUX2O14529 1486 aa26.38■■□□□ 1.81
MEG3-206ENST00000423456 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.38■■□□□ 1.81
MEG3-206ENST00000423456 CLIP1P30622 1438 aa26.33■■□□□ 1.81
MEG3-206ENST00000423456 IGF1RP08069 1367 aa26.32■■□□□ 1.8
MEG3-206ENST00000423456 HRCP23327 699 aa26.31■■□□□ 1.8
MEG3-206ENST00000423456 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
MEG3-206ENST00000423456 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
MEG3-206ENST00000423456 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.28■■□□□ 1.8
MEG3-206ENST00000423456 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.23■■□□□ 1.79
MEG3-206ENST00000423456 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.21■■□□□ 1.79
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MEG3-206ENST00000423456 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.18■■□□□ 1.78
MEG3-206ENST00000423456 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.17■■□□□ 1.78
MEG3-206ENST00000423456 WDR97A6NE52 1622 aa26.13■■□□□ 1.77
MEG3-206ENST00000423456 ARAP1Q96P48 1450 aa26.06■■□□□ 1.76
MEG3-206ENST00000423456 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.02■■□□□ 1.76
MEG3-206ENST00000423456 CUL7Q14999 1698 aa26.01■■□□□ 1.75
MEG3-206ENST00000423456 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.01■■□□□ 1.75
MEG3-206ENST00000423456 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
MEG3-206ENST00000423456 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
MEG3-206ENST00000423456 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.97■■□□□ 1.75
MEG3-206ENST00000423456 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.94■■□□□ 1.74
MEG3-206ENST00000423456 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
MEG3-206ENST00000423456 WDR62O43379 1518 aa25.87■■□□□ 1.73
MEG3-206ENST00000423456 APLP2Q06481 763 aa25.85■■□□□ 1.73
MEG3-206ENST00000423456 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
MEG3-206ENST00000423456 IFT140Q96RY7 1462 aa25.77■■□□□ 1.72
MEG3-206ENST00000423456 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.76■■□□□ 1.71
MEG3-206ENST00000423456 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
MEG3-206ENST00000423456 PBRM1Q86U86 1689 aa25.72■■□□□ 1.71
MEG3-206ENST00000423456 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.72■■□□□ 1.71
MEG3-206ENST00000423456 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
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