RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.11■■□□□ 1.13
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LRRTM4-202ENST00000409093 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
LRRTM4-202ENST00000409093 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.27■□□□□ 0.52
LRRTM4-202ENST00000409093 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.25■□□□□ 0.51
LRRTM4-202ENST00000409093 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.24■□□□□ 0.51
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCC9O60706 1549 aa18.02■□□□□ 0.48
LRRTM4-202ENST00000409093 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRTM4-202ENST00000409093 NACADO15069 1562 aa17.82■□□□□ 0.44
LRRTM4-202ENST00000409093 SCRIBQ14160 1630 aa17.73■□□□□ 0.43
LRRTM4-202ENST00000409093 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.64■□□□□ 0.41
LRRTM4-202ENST00000409093 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
LRRTM4-202ENST00000409093 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.34■□□□□ 0.37
LRRTM4-202ENST00000409093 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
LRRTM4-202ENST00000409093 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.18■□□□□ 0.34
LRRTM4-202ENST00000409093 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.1■□□□□ 0.33
LRRTM4-202ENST00000409093 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.1■□□□□ 0.33
LRRTM4-202ENST00000409093 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
LRRTM4-202ENST00000409093 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
LRRTM4-202ENST00000409093 WIZO95785 1651 aa17■□□□□ 0.31
LRRTM4-202ENST00000409093 SMARCA4P51532 1647 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRTM4-202ENST00000409093 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.93■□□□□ 0.3
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LRRTM4-202ENST00000409093 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.72■□□□□ 0.27
LRRTM4-202ENST00000409093 SMARCA2P51531 1590 aa16.66■□□□□ 0.26
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.63■□□□□ 0.25
LRRTM4-202ENST00000409093 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.63■□□□□ 0.25
LRRTM4-202ENST00000409093 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
LRRTM4-202ENST00000409093 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM41Q8WV44 630 aa16.54■□□□□ 0.24
LRRTM4-202ENST00000409093 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
LRRTM4-202ENST00000409093 HMGXB3Q12766 1538 aa16.45■□□□□ 0.22
LRRTM4-202ENST00000409093 NCAPD3P42695 1498 aa16.43■□□□□ 0.22
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCC8Q09428 1581 aa16.38■□□□□ 0.21
LRRTM4-202ENST00000409093 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRTM4-202ENST00000409093 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.31■□□□□ 0.2
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
LRRTM4-202ENST00000409093 MYT1Q01538 1121 aa16.27■□□□□ 0.19
LRRTM4-202ENST00000409093 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
LRRTM4-202ENST00000409093 SYNJ1O43426 1573 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRTM4-202ENST00000409093 CFTRP13569 1480 aa16.13■□□□□ 0.17
LRRTM4-202ENST00000409093 PRDM2Q13029 1718 aa16.12■□□□□ 0.17
LRRTM4-202ENST00000409093 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRTM4-202ENST00000409093 SOGA1O94964 1423 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRTM4-202ENST00000409093 TOP2BQ02880 1626 aa16.07■□□□□ 0.16
LRRTM4-202ENST00000409093 EEA1Q15075 1411 aa16.06■□□□□ 0.16
LRRTM4-202ENST00000409093 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.05■□□□□ 0.16
LRRTM4-202ENST00000409093 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.04■□□□□ 0.16
LRRTM4-202ENST00000409093 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM4-202ENST00000409093 CUX1P39880 1505 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM4-202ENST00000409093 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM4-202ENST00000409093 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.89■□□□□ 0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 GOLGA3Q08378 1498 aa15.88■□□□□ 0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 NESP48681 1621 aa15.88■□□□□ 0.13
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LRRTM4-202ENST00000409093 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.87■□□□□ 0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.86■□□□□ 0.13
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LRRTM4-202ENST00000409093 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.83■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 CEP162Q5TB80 1403 aa15.81■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 PCGF6Q9BYE7 350 aa15.79■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 KIF27Q86VH2 1401 aa15.79■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.79■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.78■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.76■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.74■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 TOPBP1Q92547 1522 aa15.73■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 CUX2O14529 1486 aa15.72■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.72■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 PRXQ9BXM0 1461 aa15.71■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.71■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
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LRRTM4-202ENST00000409093 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
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LRRTM4-202ENST00000409093 CLIP1P30622 1438 aa15.64■□□□□ 0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.64■□□□□ 0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.63■□□□□ 0.09
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LRRTM4-202ENST00000409093 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
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LRRTM4-202ENST00000409093 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 HRCP23327 699 aa15.46■□□□□ 0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.46■□□□□ 0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ARAP1Q96P48 1450 aa15.45■□□□□ 0.06
LRRTM4-202ENST00000409093 ERCC6Q03468 1493 aa15.44■□□□□ 0.06
LRRTM4-202ENST00000409093 WDR62O43379 1518 aa15.44■□□□□ 0.06
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.41■□□□□ 0.06
LRRTM4-202ENST00000409093 APLP2Q06481 763 aa15.4■□□□□ 0.06
LRRTM4-202ENST00000409093 PBRM1Q86U86 1689 aa15.39■□□□□ 0.05
LRRTM4-202ENST00000409093 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.39■□□□□ 0.05
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