RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393119.6

MKS1-202, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-202ENST00000393119 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.35■■■□□ 2.93
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MKS1-202ENST00000393119 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.86■■■□□ 2.05
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MKS1-202ENST00000393119 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.56■■□□□ 1.84
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MKS1-202ENST00000393119 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.93■■□□□ 1.74
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MKS1-202ENST00000393119 SMARCA4P51532 1647 aa25.57■■□□□ 1.68
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MKS1-202ENST00000393119 HMGXB3Q12766 1538 aa24.71■■□□□ 1.55
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MKS1-202ENST00000393119 CFTRP13569 1480 aa24.38■■□□□ 1.49
MKS1-202ENST00000393119 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.31■■□□□ 1.48
MKS1-202ENST00000393119 NESP48681 1621 aa24.27■■□□□ 1.48
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MKS1-202ENST00000393119 TOP2BQ02880 1626 aa24.14■■□□□ 1.45
MKS1-202ENST00000393119 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.07■■□□□ 1.44
MKS1-202ENST00000393119 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.04■■□□□ 1.44
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MKS1-202ENST00000393119 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.82■■□□□ 1.4
MKS1-202ENST00000393119 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.81■■□□□ 1.4
MKS1-202ENST00000393119 TOPBP1Q92547 1522 aa23.81■■□□□ 1.4
MKS1-202ENST00000393119 CUX2O14529 1486 aa23.81■■□□□ 1.4
MKS1-202ENST00000393119 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
MKS1-202ENST00000393119 CEP162Q5TB80 1403 aa23.8■■□□□ 1.4
MKS1-202ENST00000393119 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.79■■□□□ 1.4
MKS1-202ENST00000393119 KIF27Q86VH2 1401 aa23.78■■□□□ 1.4
MKS1-202ENST00000393119 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.75■■□□□ 1.39
MKS1-202ENST00000393119 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.75■■□□□ 1.39
MKS1-202ENST00000393119 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
MKS1-202ENST00000393119 KIF21BO75037 1637 aa23.72■■□□□ 1.39
MKS1-202ENST00000393119 IGF1RP08069 1367 aa23.69■■□□□ 1.38
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MKS1-202ENST00000393119 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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MKS1-202ENST00000393119 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.38■■□□□ 1.33
MKS1-202ENST00000393119 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
MKS1-202ENST00000393119 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.33■■□□□ 1.32
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MKS1-202ENST00000393119 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.3■■□□□ 1.32
MKS1-202ENST00000393119 HRCP23327 699 aa23.28■■□□□ 1.32
MKS1-202ENST00000393119 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.28■■□□□ 1.32
MKS1-202ENST00000393119 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
MKS1-202ENST00000393119 IFT140Q96RY7 1462 aa23.19■■□□□ 1.3
MKS1-202ENST00000393119 CUL7Q14999 1698 aa23.18■■□□□ 1.3
MKS1-202ENST00000393119 APLP2Q06481 763 aa23.14■■□□□ 1.3
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