RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.45■■■□□ 2.62
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ZBED1-201ENST00000381218 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.16■■□□□ 1.62
ZBED1-201ENST00000381218 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.13■■□□□ 1.61
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ZBED1-201ENST00000381218 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.88■■□□□ 1.57
ZBED1-201ENST00000381218 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ZBED1-201ENST00000381218 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.71■■□□□ 1.55
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ZBED1-201ENST00000381218 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.62■■□□□ 1.53
ZBED1-201ENST00000381218 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.6■■□□□ 1.53
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ZBED1-201ENST00000381218 WIZO95785 1651 aa24.46■■□□□ 1.51
ZBED1-201ENST00000381218 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.4■■□□□ 1.5
ZBED1-201ENST00000381218 TRIM41Q8WV44 630 aa24.3■■□□□ 1.48
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ZBED1-201ENST00000381218 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.17■■□□□ 1.46
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ZBED1-201ENST00000381218 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
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ZBED1-201ENST00000381218 SMARCA2P51531 1590 aa23.77■■□□□ 1.4
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ZBED1-201ENST00000381218 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.66■■□□□ 1.38
ZBED1-201ENST00000381218 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
ZBED1-201ENST00000381218 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
ZBED1-201ENST00000381218 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
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ZBED1-201ENST00000381218 SOGA1O94964 1423 aa23.54■■□□□ 1.36
ZBED1-201ENST00000381218 NEUROD1Q13562 356 aa23.52■■□□□ 1.36
ZBED1-201ENST00000381218 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.5■■□□□ 1.35
ZBED1-201ENST00000381218 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ZBED1-201ENST00000381218 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ZBED1-201ENST00000381218 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.43■■□□□ 1.34
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ZBED1-201ENST00000381218 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ZBED1-201ENST00000381218 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
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ZBED1-201ENST00000381218 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.23■■□□□ 1.31
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ZBED1-201ENST00000381218 CEP162Q5TB80 1403 aa23.09■■□□□ 1.29
ZBED1-201ENST00000381218 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.07■■□□□ 1.28
ZBED1-201ENST00000381218 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
ZBED1-201ENST00000381218 HMGXB3Q12766 1538 aa23■■□□□ 1.27
ZBED1-201ENST00000381218 GOLGA3Q08378 1498 aa22.97■■□□□ 1.27
ZBED1-201ENST00000381218 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ZBED1-201ENST00000381218 NESP48681 1621 aa22.92■■□□□ 1.26
ZBED1-201ENST00000381218 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.92■■□□□ 1.26
ZBED1-201ENST00000381218 CUX1P39880 1505 aa22.9■■□□□ 1.26
ZBED1-201ENST00000381218 CFTRP13569 1480 aa22.88■■□□□ 1.25
ZBED1-201ENST00000381218 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.86■■□□□ 1.25
ZBED1-201ENST00000381218 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.82■■□□□ 1.24
ZBED1-201ENST00000381218 TOP2BQ02880 1626 aa22.81■■□□□ 1.24
ZBED1-201ENST00000381218 KIF21BO75037 1637 aa22.8■■□□□ 1.24
ZBED1-201ENST00000381218 CLIP1P30622 1438 aa22.71■■□□□ 1.23
ZBED1-201ENST00000381218 CUX2O14529 1486 aa22.67■■□□□ 1.22
ZBED1-201ENST00000381218 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.66■■□□□ 1.22
ZBED1-201ENST00000381218 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.64■■□□□ 1.22
ZBED1-201ENST00000381218 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.63■■□□□ 1.21
ZBED1-201ENST00000381218 P3H3Q8IVL6 736 aa22.63■■□□□ 1.21
ZBED1-201ENST00000381218 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.62■■□□□ 1.21
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ZBED1-201ENST00000381218 KIF27Q86VH2 1401 aa22.6■■□□□ 1.21
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ZBED1-201ENST00000381218 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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ZBED1-201ENST00000381218 PRXQ9BXM0 1461 aa22.51■■□□□ 1.19
ZBED1-201ENST00000381218 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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ZBED1-201ENST00000381218 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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ZBED1-201ENST00000381218 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ZBED1-201ENST00000381218 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ZBED1-201ENST00000381218 ARAP1Q96P48 1450 aa22.41■■□□□ 1.18
ZBED1-201ENST00000381218 TOPBP1Q92547 1522 aa22.4■■□□□ 1.18
ZBED1-201ENST00000381218 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.4■■□□□ 1.18
ZBED1-201ENST00000381218 ITGAEP38570 1179 aa22.38■■□□□ 1.17
ZBED1-201ENST00000381218 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ZBED1-201ENST00000381218 BCL11AQ9H165 835 aa22.37■■□□□ 1.17
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