RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326434.9

CRELD1-201, Transcript of cysteine rich with EGF like domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CRELD1, Length 1,994 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1-201ENST00000326434 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.77■■■■□ 3.48
CRELD1-201ENST00000326434 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.03■■■□□ 2.72
CRELD1-201ENST00000326434 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
CRELD1-201ENST00000326434 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.49■■■□□ 2.47
CRELD1-201ENST00000326434 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.34■■■□□ 2.45
CRELD1-201ENST00000326434 ABCC9O60706 1549 aa30.31■■■□□ 2.44
CRELD1-201ENST00000326434 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.24■■■□□ 2.43
CRELD1-201ENST00000326434 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.92■■■□□ 2.38
CRELD1-201ENST00000326434 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CRELD1-201ENST00000326434 NACADO15069 1562 aa29.75■■■□□ 2.35
CRELD1-201ENST00000326434 SCRIBQ14160 1630 aa29.57■■■□□ 2.32
CRELD1-201ENST00000326434 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.49■■■□□ 2.31
CRELD1-201ENST00000326434 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.12■■■□□ 2.25
CRELD1-201ENST00000326434 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.07■■■□□ 2.24
CRELD1-201ENST00000326434 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.76■■■□□ 2.19
CRELD1-201ENST00000326434 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CRELD1-201ENST00000326434 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.65■■■□□ 2.18
CRELD1-201ENST00000326434 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
CRELD1-201ENST00000326434 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.49■■■□□ 2.15
CRELD1-201ENST00000326434 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CRELD1-201ENST00000326434 SMARCA4P51532 1647 aa28.3■■■□□ 2.12
CRELD1-201ENST00000326434 WIZO95785 1651 aa28.29■■■□□ 2.12
CRELD1-201ENST00000326434 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28■■■□□ 2.07
CRELD1-201ENST00000326434 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.92■■■□□ 2.06
CRELD1-201ENST00000326434 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CRELD1-201ENST00000326434 TRIM41Q8WV44 630 aa27.9■■■□□ 2.06
CRELD1-201ENST00000326434 HRCP23327 699 aa27.88■■■□□ 2.05
CRELD1-201ENST00000326434 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CRELD1-201ENST00000326434 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.82■■■□□ 2.04
CRELD1-201ENST00000326434 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.77■■■□□ 2.04
CRELD1-201ENST00000326434 SMARCA2P51531 1590 aa27.7■■■□□ 2.03
CRELD1-201ENST00000326434 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.62■■■□□ 2.01
CRELD1-201ENST00000326434 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CRELD1-201ENST00000326434 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CRELD1-201ENST00000326434 HMGXB3Q12766 1538 aa27.48■■□□□ 1.99
CRELD1-201ENST00000326434 NCAPD3P42695 1498 aa27.46■■□□□ 1.99
CRELD1-201ENST00000326434 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
CRELD1-201ENST00000326434 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.4■■□□□ 1.98
CRELD1-201ENST00000326434 ABCC8Q09428 1581 aa27.33■■□□□ 1.97
CRELD1-201ENST00000326434 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.29■■□□□ 1.96
CRELD1-201ENST00000326434 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
CRELD1-201ENST00000326434 EEA1Q15075 1411 aa27.08■■□□□ 1.93
CRELD1-201ENST00000326434 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.05■■□□□ 1.92
CRELD1-201ENST00000326434 SOGA1O94964 1423 aa26.98■■□□□ 1.91
CRELD1-201ENST00000326434 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
CRELD1-201ENST00000326434 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CRELD1-201ENST00000326434 CFTRP13569 1480 aa26.91■■□□□ 1.9
CRELD1-201ENST00000326434 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.88■■□□□ 1.89
CRELD1-201ENST00000326434 SYNJ1O43426 1573 aa26.88■■□□□ 1.89
CRELD1-201ENST00000326434 PRDM2Q13029 1718 aa26.86■■□□□ 1.89
CRELD1-201ENST00000326434 CEP162Q5TB80 1403 aa26.85■■□□□ 1.89
CRELD1-201ENST00000326434 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.84■■□□□ 1.89
CRELD1-201ENST00000326434 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.8■■□□□ 1.88
CRELD1-201ENST00000326434 GOLGA3Q08378 1498 aa26.79■■□□□ 1.88
CRELD1-201ENST00000326434 KIF21BO75037 1637 aa26.76■■□□□ 1.87
CRELD1-201ENST00000326434 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.75■■□□□ 1.87
CRELD1-201ENST00000326434 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.67■■□□□ 1.86
CRELD1-201ENST00000326434 TOP2BQ02880 1626 aa26.67■■□□□ 1.86
CRELD1-201ENST00000326434 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.66■■□□□ 1.86
CRELD1-201ENST00000326434 NESP48681 1621 aa26.66■■□□□ 1.86
CRELD1-201ENST00000326434 CUX1P39880 1505 aa26.63■■□□□ 1.85
CRELD1-201ENST00000326434 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CRELD1-201ENST00000326434 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.53■■□□□ 1.84
CRELD1-201ENST00000326434 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.51■■□□□ 1.83
CRELD1-201ENST00000326434 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.39■■□□□ 1.82
CRELD1-201ENST00000326434 CLIP1P30622 1438 aa26.39■■□□□ 1.81
CRELD1-201ENST00000326434 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.37■■□□□ 1.81
CRELD1-201ENST00000326434 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.36■■□□□ 1.81
CRELD1-201ENST00000326434 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.32■■□□□ 1.8
CRELD1-201ENST00000326434 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.3■■□□□ 1.8
CRELD1-201ENST00000326434 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.29■■□□□ 1.8
CRELD1-201ENST00000326434 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CRELD1-201ENST00000326434 PRXQ9BXM0 1461 aa26.28■■□□□ 1.8
CRELD1-201ENST00000326434 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.26■■□□□ 1.8
CRELD1-201ENST00000326434 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CRELD1-201ENST00000326434 TOPBP1Q92547 1522 aa26.26■■□□□ 1.79
CRELD1-201ENST00000326434 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CRELD1-201ENST00000326434 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CRELD1-201ENST00000326434 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CRELD1-201ENST00000326434 KIF27Q86VH2 1401 aa26.14■■□□□ 1.78
CRELD1-201ENST00000326434 ERCC6Q03468 1493 aa26.11■■□□□ 1.77
CRELD1-201ENST00000326434 CUX2O14529 1486 aa26.09■■□□□ 1.77
CRELD1-201ENST00000326434 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.09■■□□□ 1.77
CRELD1-201ENST00000326434 WDR97A6NE52 1622 aa26.06■■□□□ 1.76
CRELD1-201ENST00000326434 ARAP1Q96P48 1450 aa26.05■■□□□ 1.76
CRELD1-201ENST00000326434 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.02■■□□□ 1.76
CRELD1-201ENST00000326434 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.99■■□□□ 1.75
CRELD1-201ENST00000326434 APLP2Q06481 763 aa25.96■■□□□ 1.75
CRELD1-201ENST00000326434 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CRELD1-201ENST00000326434 IGF1RP08069 1367 aa25.91■■□□□ 1.74
CRELD1-201ENST00000326434 WDR62O43379 1518 aa25.9■■□□□ 1.74
CRELD1-201ENST00000326434 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CRELD1-201ENST00000326434 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.88■■□□□ 1.73
CRELD1-201ENST00000326434 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.84■■□□□ 1.73
CRELD1-201ENST00000326434 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CRELD1-201ENST00000326434 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CRELD1-201ENST00000326434 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CRELD1-201ENST00000326434 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.75■■□□□ 1.71
CRELD1-201ENST00000326434 CUL7Q14999 1698 aa25.73■■□□□ 1.71
CRELD1-201ENST00000326434 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 207.4 ms