RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322396.6

PRMT9-201, Transcript of protein arginine methyltransferase 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRMT9, Length 3,528 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT9-201ENST00000322396 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.67■■■□□ 2.02
PRMT9-201ENST00000322396 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.91■■□□□ 1.74
PRMT9-201ENST00000322396 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PRMT9-201ENST00000322396 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.34■■□□□ 1.65
PRMT9-201ENST00000322396 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PRMT9-201ENST00000322396 HRCP23327 699 aa25.15■■□□□ 1.62
PRMT9-201ENST00000322396 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.03■■□□□ 1.6
PRMT9-201ENST00000322396 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.64■■□□□ 1.53
PRMT9-201ENST00000322396 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.59■■□□□ 1.53
PRMT9-201ENST00000322396 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.57■■□□□ 1.52
PRMT9-201ENST00000322396 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.54■■□□□ 1.52
PRMT9-201ENST00000322396 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PRMT9-201ENST00000322396 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PRMT9-201ENST00000322396 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PRMT9-201ENST00000322396 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PRMT9-201ENST00000322396 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
PRMT9-201ENST00000322396 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
PRMT9-201ENST00000322396 TRIM41Q8WV44 630 aa23.55■■□□□ 1.36
PRMT9-201ENST00000322396 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PRMT9-201ENST00000322396 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.52■■□□□ 1.35
PRMT9-201ENST00000322396 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PRMT9-201ENST00000322396 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PRMT9-201ENST00000322396 NEUROD1Q13562 356 aa23.43■■□□□ 1.34
PRMT9-201ENST00000322396 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.42■■□□□ 1.34
PRMT9-201ENST00000322396 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PRMT9-201ENST00000322396 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PRMT9-201ENST00000322396 MYT1Q01538 1121 aa23.28■■□□□ 1.32
PRMT9-201ENST00000322396 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.19■■□□□ 1.3
PRMT9-201ENST00000322396 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PRMT9-201ENST00000322396 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PRMT9-201ENST00000322396 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PRMT9-201ENST00000322396 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PRMT9-201ENST00000322396 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PRMT9-201ENST00000322396 MIER1Q8N108 512 aa22.62■■□□□ 1.21
PRMT9-201ENST00000322396 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PRMT9-201ENST00000322396 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PRMT9-201ENST00000322396 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.4■■□□□ 1.18
PRMT9-201ENST00000322396 SCRIBQ14160 1630 aa22.38■■□□□ 1.17
PRMT9-201ENST00000322396 BCANQ96GW7 911 aa22.38■■□□□ 1.17
PRMT9-201ENST00000322396 APLP2Q06481 763 aa22.23■■□□□ 1.15
PRMT9-201ENST00000322396 ITGAEP38570 1179 aa22.15■■□□□ 1.14
PRMT9-201ENST00000322396 ABCC9O60706 1549 aa22.11■■□□□ 1.13
PRMT9-201ENST00000322396 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.11■■□□□ 1.13
PRMT9-201ENST00000322396 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PRMT9-201ENST00000322396 CEP162Q5TB80 1403 aa22.04■■□□□ 1.12
PRMT9-201ENST00000322396 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.98■■□□□ 1.11
PRMT9-201ENST00000322396 SOGA1O94964 1423 aa21.94■■□□□ 1.1
PRMT9-201ENST00000322396 KCNH8Q96L42 1107 aa21.93■■□□□ 1.1
PRMT9-201ENST00000322396 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.9■■□□□ 1.1
PRMT9-201ENST00000322396 ABCC8Q09428 1581 aa21.9■■□□□ 1.1
PRMT9-201ENST00000322396 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.88■■□□□ 1.09
PRMT9-201ENST00000322396 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.87■■□□□ 1.09
PRMT9-201ENST00000322396 FKBP8Q14318 412 aa21.86■■□□□ 1.09
PRMT9-201ENST00000322396 BCL11AQ9H165 835 aa21.85■■□□□ 1.09
PRMT9-201ENST00000322396 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.84■■□□□ 1.09
PRMT9-201ENST00000322396 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PRMT9-201ENST00000322396 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.8■■□□□ 1.08
PRMT9-201ENST00000322396 WIZO95785 1651 aa21.76■■□□□ 1.07
PRMT9-201ENST00000322396 TRIM52Q96A61 297 aa21.73■■□□□ 1.07
PRMT9-201ENST00000322396 NEFLP07196 543 aa21.71■■□□□ 1.07
PRMT9-201ENST00000322396 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PRMT9-201ENST00000322396 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.67■■□□□ 1.06
PRMT9-201ENST00000322396 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PRMT9-201ENST00000322396 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PRMT9-201ENST00000322396 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.63■■□□□ 1.05
PRMT9-201ENST00000322396 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
PRMT9-201ENST00000322396 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.58■■□□□ 1.05
PRMT9-201ENST00000322396 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
PRMT9-201ENST00000322396 CLIP1P30622 1438 aa21.55■■□□□ 1.04
PRMT9-201ENST00000322396 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PRMT9-201ENST00000322396 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRMT9-201ENST00000322396 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PRMT9-201ENST00000322396 GOLGA3Q08378 1498 aa21.45■■□□□ 1.02
PRMT9-201ENST00000322396 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.43■■□□□ 1.02
PRMT9-201ENST00000322396 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PRMT9-201ENST00000322396 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PRMT9-201ENST00000322396 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.32■■□□□ 1
PRMT9-201ENST00000322396 ANP32CO43423 234 aa21.29■■□□□ 1
PRMT9-201ENST00000322396 P3H3Q8IVL6 736 aa21.29■■□□□ 1
PRMT9-201ENST00000322396 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.26■□□□□ 0.99
PRMT9-201ENST00000322396 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.99
PRMT9-201ENST00000322396 NBR1Q14596 966 aa21.24■□□□□ 0.99
PRMT9-201ENST00000322396 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.21■□□□□ 0.99
PRMT9-201ENST00000322396 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PRMT9-201ENST00000322396 MSH5O43196 834 aa21.2■□□□□ 0.98
PRMT9-201ENST00000322396 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.18■□□□□ 0.98
PRMT9-201ENST00000322396 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
PRMT9-201ENST00000322396 EEA1Q15075 1411 aa21.18■□□□□ 0.98
PRMT9-201ENST00000322396 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.09■□□□□ 0.97
PRMT9-201ENST00000322396 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.05■□□□□ 0.96
PRMT9-201ENST00000322396 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.05■□□□□ 0.96
PRMT9-201ENST00000322396 SMARCA2P51531 1590 aa21.05■□□□□ 0.96
PRMT9-201ENST00000322396 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.05■□□□□ 0.96
PRMT9-201ENST00000322396 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PRMT9-201ENST00000322396 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PRMT9-201ENST00000322396 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.01■□□□□ 0.95
PRMT9-201ENST00000322396 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PRMT9-201ENST00000322396 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PRMT9-201ENST00000322396 KIF21BO75037 1637 aa20.96■□□□□ 0.95
PRMT9-201ENST00000322396 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
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