RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
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HOXD8-201ENST00000313173 ADAMTS12P58397 1594 aa41.32■■■■■ 4.21
HOXD8-201ENST00000313173 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.32■■■■■ 4.2
HOXD8-201ENST00000313173 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.31■■■■■ 4.2
HOXD8-201ENST00000313173 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.16■■■■■ 4.18
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HOXD8-201ENST00000313173 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.07■■■■■ 4.17
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HOXD8-201ENST00000313173 TIAM1Q13009 1591 aa41■■■■■ 4.15
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HOXD8-201ENST00000313173 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.94■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 FMN1Q68DA7 1419 aa40.92■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 SYNJ2O15056 1496 aa40.91■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.91■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.9■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 GRIN2AQ12879 1464 aa40.88■■■■■ 4.13
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HOXD8-201ENST00000313173 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.78■■■■■ 4.12
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.77■■■■■ 4.12
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HOXD8-201ENST00000313173 CHD1O14646 1710 aa40.55■■■■■ 4.08
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA0556O60303 1618 aa40.54■■■■■ 4.08
HOXD8-201ENST00000313173 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.53■■■■■ 4.08
HOXD8-201ENST00000313173 DISP1Q96F81 1524 aa40.51■■■■■ 4.08
HOXD8-201ENST00000313173 HECW1Q76N89 1606 aa40.47■■■■■ 4.07
HOXD8-201ENST00000313173 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.43■■■■■ 4.06
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.43■■■■■ 4.06
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HOXD8-201ENST00000313173 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.32■■■■■ 4.05
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HOXD8-201ENST00000313173 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.21■■■■■ 4.03
HOXD8-201ENST00000313173 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.2■■■■■ 4.03
HOXD8-201ENST00000313173 NCOA2Q15596 1464 aa40.17■■■■■ 4.02
HOXD8-201ENST00000313173 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
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HOXD8-201ENST00000313173 OSCARQ8IYS5 282 aa39.92■■■■□ 3.98
HOXD8-201ENST00000313173 ABCA8O94911 1581 aa39.91■■■■□ 3.98
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HOXD8-201ENST00000313173 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.85■■■■□ 3.97
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HOXD8-201ENST00000313173 MIA2Q96PC5 1412 aa39.78■■■■□ 3.96
HOXD8-201ENST00000313173 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
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HOXD8-201ENST00000313173 ATP10BO94823 1461 aa39.65■■■■□ 3.94
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HOXD8-201ENST00000313173 KIF14Q15058 1648 aa39.58■■■■□ 3.93
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HOXD8-201ENST00000313173 DAPK1P53355 1430 aa39.37■■■■□ 3.89
HOXD8-201ENST00000313173 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.36■■■■□ 3.89
HOXD8-201ENST00000313173 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.35■■■■□ 3.89
HOXD8-201ENST00000313173 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
HOXD8-201ENST00000313173 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.32■■■■□ 3.89
HOXD8-201ENST00000313173 ABCC5O15440 1437 aa39.32■■■■□ 3.89
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