RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278618.8

AASDHPPT-201, Transcript of aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AASDHPPT, Length 2,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AASDHPPT-201ENST00000278618 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.13■■■■□ 3.21
AASDHPPT-201ENST00000278618 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.65■■■□□ 2.5
AASDHPPT-201ENST00000278618 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.63■■■□□ 2.49
AASDHPPT-201ENST00000278618 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.69■■■□□ 2.34
AASDHPPT-201ENST00000278618 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
AASDHPPT-201ENST00000278618 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
AASDHPPT-201ENST00000278618 ABCC9O60706 1549 aa29.18■■■□□ 2.26
AASDHPPT-201ENST00000278618 SCRIBQ14160 1630 aa28.59■■■□□ 2.17
AASDHPPT-201ENST00000278618 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.27■■■□□ 2.12
AASDHPPT-201ENST00000278618 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
AASDHPPT-201ENST00000278618 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.01■■■□□ 2.07
AASDHPPT-201ENST00000278618 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.92■■■□□ 2.06
AASDHPPT-201ENST00000278618 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.89■■■□□ 2.06
AASDHPPT-201ENST00000278618 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.81■■■□□ 2.04
AASDHPPT-201ENST00000278618 NACADO15069 1562 aa27.79■■■□□ 2.04
AASDHPPT-201ENST00000278618 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
AASDHPPT-201ENST00000278618 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
AASDHPPT-201ENST00000278618 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.64■■■□□ 2.01
AASDHPPT-201ENST00000278618 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.63■■■□□ 2.01
AASDHPPT-201ENST00000278618 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.55■■■□□ 2
AASDHPPT-201ENST00000278618 WIZO95785 1651 aa27.38■■□□□ 1.97
AASDHPPT-201ENST00000278618 TRIM41Q8WV44 630 aa27.31■■□□□ 1.96
AASDHPPT-201ENST00000278618 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.28■■□□□ 1.96
AASDHPPT-201ENST00000278618 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.02■■□□□ 1.92
AASDHPPT-201ENST00000278618 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
AASDHPPT-201ENST00000278618 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.88■■□□□ 1.89
AASDHPPT-201ENST00000278618 SMARCA4P51532 1647 aa26.88■■□□□ 1.89
AASDHPPT-201ENST00000278618 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
AASDHPPT-201ENST00000278618 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.77■■□□□ 1.88
AASDHPPT-201ENST00000278618 ABCC8Q09428 1581 aa26.76■■□□□ 1.87
AASDHPPT-201ENST00000278618 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
AASDHPPT-201ENST00000278618 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
AASDHPPT-201ENST00000278618 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
AASDHPPT-201ENST00000278618 SMARCA2P51531 1590 aa26.55■■□□□ 1.84
AASDHPPT-201ENST00000278618 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.47■■□□□ 1.83
AASDHPPT-201ENST00000278618 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
AASDHPPT-201ENST00000278618 SOGA1O94964 1423 aa26.38■■□□□ 1.81
AASDHPPT-201ENST00000278618 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.36■■□□□ 1.81
AASDHPPT-201ENST00000278618 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
AASDHPPT-201ENST00000278618 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.25■■□□□ 1.79
AASDHPPT-201ENST00000278618 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
AASDHPPT-201ENST00000278618 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
AASDHPPT-201ENST00000278618 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.05■■□□□ 1.76
AASDHPPT-201ENST00000278618 SYNJ1O43426 1573 aa26.01■■□□□ 1.75
AASDHPPT-201ENST00000278618 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.01■■□□□ 1.75
AASDHPPT-201ENST00000278618 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
AASDHPPT-201ENST00000278618 HRCP23327 699 aa25.91■■□□□ 1.74
AASDHPPT-201ENST00000278618 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.87■■□□□ 1.73
AASDHPPT-201ENST00000278618 NCAPD3P42695 1498 aa25.86■■□□□ 1.73
AASDHPPT-201ENST00000278618 NESP48681 1621 aa25.76■■□□□ 1.72
AASDHPPT-201ENST00000278618 CEP162Q5TB80 1403 aa25.76■■□□□ 1.71
AASDHPPT-201ENST00000278618 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
AASDHPPT-201ENST00000278618 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.66■■□□□ 1.7
AASDHPPT-201ENST00000278618 HMGXB3Q12766 1538 aa25.64■■□□□ 1.7
AASDHPPT-201ENST00000278618 CUX1P39880 1505 aa25.62■■□□□ 1.69
AASDHPPT-201ENST00000278618 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.57■■□□□ 1.68
AASDHPPT-201ENST00000278618 CFTRP13569 1480 aa25.56■■□□□ 1.68
AASDHPPT-201ENST00000278618 P3H3Q8IVL6 736 aa25.55■■□□□ 1.68
AASDHPPT-201ENST00000278618 GOLGA3Q08378 1498 aa25.53■■□□□ 1.68
AASDHPPT-201ENST00000278618 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.52■■□□□ 1.68
AASDHPPT-201ENST00000278618 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
AASDHPPT-201ENST00000278618 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
AASDHPPT-201ENST00000278618 TOP2BQ02880 1626 aa25.45■■□□□ 1.66
AASDHPPT-201ENST00000278618 CLIP1P30622 1438 aa25.43■■□□□ 1.66
AASDHPPT-201ENST00000278618 CUX2O14529 1486 aa25.42■■□□□ 1.66
AASDHPPT-201ENST00000278618 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.41■■□□□ 1.66
AASDHPPT-201ENST00000278618 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.4■■□□□ 1.66
AASDHPPT-201ENST00000278618 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.4■■□□□ 1.66
AASDHPPT-201ENST00000278618 EEA1Q15075 1411 aa25.39■■□□□ 1.66
AASDHPPT-201ENST00000278618 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
AASDHPPT-201ENST00000278618 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.34■■□□□ 1.65
AASDHPPT-201ENST00000278618 APLP2Q06481 763 aa25.34■■□□□ 1.65
AASDHPPT-201ENST00000278618 KIF27Q86VH2 1401 aa25.3■■□□□ 1.64
AASDHPPT-201ENST00000278618 ITGAEP38570 1179 aa25.28■■□□□ 1.64
AASDHPPT-201ENST00000278618 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
AASDHPPT-201ENST00000278618 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.24■■□□□ 1.63
AASDHPPT-201ENST00000278618 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
AASDHPPT-201ENST00000278618 IGF1RP08069 1367 aa25.19■■□□□ 1.62
AASDHPPT-201ENST00000278618 ARID3CA6NKF2 412 aa25.18■■□□□ 1.62
AASDHPPT-201ENST00000278618 KIF21BO75037 1637 aa25.14■■□□□ 1.61
AASDHPPT-201ENST00000278618 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.13■■□□□ 1.61
AASDHPPT-201ENST00000278618 PRXQ9BXM0 1461 aa25.12■■□□□ 1.61
AASDHPPT-201ENST00000278618 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
AASDHPPT-201ENST00000278618 TOPBP1Q92547 1522 aa25.08■■□□□ 1.61
AASDHPPT-201ENST00000278618 ARAP1Q96P48 1450 aa25.06■■□□□ 1.6
AASDHPPT-201ENST00000278618 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
AASDHPPT-201ENST00000278618 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.04■■□□□ 1.6
AASDHPPT-201ENST00000278618 FBLN2P98095 1184 aa24.95■■□□□ 1.58
AASDHPPT-201ENST00000278618 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.93■■□□□ 1.58
AASDHPPT-201ENST00000278618 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
AASDHPPT-201ENST00000278618 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.91■■□□□ 1.58
AASDHPPT-201ENST00000278618 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.91■■□□□ 1.58
AASDHPPT-201ENST00000278618 PRDM2Q13029 1718 aa24.9■■□□□ 1.58
AASDHPPT-201ENST00000278618 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.89■■□□□ 1.58
AASDHPPT-201ENST00000278618 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.88■■□□□ 1.57
AASDHPPT-201ENST00000278618 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.81■■□□□ 1.56
AASDHPPT-201ENST00000278618 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
AASDHPPT-201ENST00000278618 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.79■■□□□ 1.56
AASDHPPT-201ENST00000278618 ERCC6Q03468 1493 aa24.78■■□□□ 1.56
AASDHPPT-201ENST00000278618 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.8 ms