RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.2■■□□□ 1.46
TMX4-201ENST00000246024 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TMX4-201ENST00000246024 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.31■■□□□ 1.16
TMX4-201ENST00000246024 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.22■■□□□ 1.15
TMX4-201ENST00000246024 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.83■■□□□ 1.09
TMX4-201ENST00000246024 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TMX4-201ENST00000246024 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TMX4-201ENST00000246024 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TMX4-201ENST00000246024 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
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TMX4-201ENST00000246024 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
TMX4-201ENST00000246024 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.82■□□□□ 0.92
TMX4-201ENST00000246024 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TMX4-201ENST00000246024 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.53■□□□□ 0.88
TMX4-201ENST00000246024 TRIM41Q8WV44 630 aa20.46■□□□□ 0.87
TMX4-201ENST00000246024 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TMX4-201ENST00000246024 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TMX4-201ENST00000246024 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TMX4-201ENST00000246024 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.27■□□□□ 0.84
TMX4-201ENST00000246024 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX4-201ENST00000246024 NEFLP07196 543 aa20.19■□□□□ 0.82
TMX4-201ENST00000246024 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TMX4-201ENST00000246024 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TMX4-201ENST00000246024 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TMX4-201ENST00000246024 ITGAEP38570 1179 aa20.06■□□□□ 0.8
TMX4-201ENST00000246024 MYT1Q01538 1121 aa20■□□□□ 0.79
TMX4-201ENST00000246024 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
TMX4-201ENST00000246024 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.96■□□□□ 0.79
TMX4-201ENST00000246024 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
TMX4-201ENST00000246024 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
TMX4-201ENST00000246024 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TMX4-201ENST00000246024 ABCC9O60706 1549 aa19.82■□□□□ 0.76
TMX4-201ENST00000246024 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
TMX4-201ENST00000246024 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.66■□□□□ 0.74
TMX4-201ENST00000246024 FBLN2P98095 1184 aa19.62■□□□□ 0.73
TMX4-201ENST00000246024 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.47■□□□□ 0.71
TMX4-201ENST00000246024 ARID3CA6NKF2 412 aa19.45■□□□□ 0.7
TMX4-201ENST00000246024 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
TMX4-201ENST00000246024 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
TMX4-201ENST00000246024 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.34■□□□□ 0.69
TMX4-201ENST00000246024 TRIM52Q96A61 297 aa19.25■□□□□ 0.67
TMX4-201ENST00000246024 SLC24A1O60721 1099 aa19.23■□□□□ 0.67
TMX4-201ENST00000246024 P3H3Q8IVL6 736 aa19.23■□□□□ 0.67
TMX4-201ENST00000246024 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
TMX4-201ENST00000246024 BCL11AQ9H165 835 aa19.19■□□□□ 0.66
TMX4-201ENST00000246024 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
TMX4-201ENST00000246024 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
TMX4-201ENST00000246024 NEUROD1Q13562 356 aa19.15■□□□□ 0.66
TMX4-201ENST00000246024 BCANQ96GW7 911 aa19.15■□□□□ 0.66
TMX4-201ENST00000246024 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
TMX4-201ENST00000246024 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
TMX4-201ENST00000246024 HRCP23327 699 aa18.99■□□□□ 0.63
TMX4-201ENST00000246024 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
TMX4-201ENST00000246024 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
TMX4-201ENST00000246024 NEFMP07197 916 aa18.81■□□□□ 0.6
TMX4-201ENST00000246024 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
TMX4-201ENST00000246024 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TMX4-201ENST00000246024 PLEKHG5O94827 1062 aa18.71■□□□□ 0.59
TMX4-201ENST00000246024 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
TMX4-201ENST00000246024 SCRIBQ14160 1630 aa18.68■□□□□ 0.58
TMX4-201ENST00000246024 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.66■□□□□ 0.58
TMX4-201ENST00000246024 ANP32CO43423 234 aa18.63■□□□□ 0.57
TMX4-201ENST00000246024 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TMX4-201ENST00000246024 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.57
TMX4-201ENST00000246024 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.572e-7■■■□□ 19
TMX4-201ENST00000246024 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
TMX4-201ENST00000246024 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.52■□□□□ 0.56
TMX4-201ENST00000246024 A0A0G2JS52 829 aa18.5■□□□□ 0.55
TMX4-201ENST00000246024 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TMX4-201ENST00000246024 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.49■□□□□ 0.55
TMX4-201ENST00000246024 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TMX4-201ENST00000246024 KCNH8Q96L42 1107 aa18.43■□□□□ 0.54
TMX4-201ENST00000246024 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
TMX4-201ENST00000246024 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.41■□□□□ 0.54
TMX4-201ENST00000246024 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
TMX4-201ENST00000246024 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TMX4-201ENST00000246024 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TMX4-201ENST00000246024 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.33■□□□□ 0.52
TMX4-201ENST00000246024 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.33■□□□□ 0.52
TMX4-201ENST00000246024 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TMX4-201ENST00000246024 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
TMX4-201ENST00000246024 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TMX4-201ENST00000246024 C14orf37Q86TY3 774 aa18.26■□□□□ 0.51
TMX4-201ENST00000246024 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TMX4-201ENST00000246024 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TMX4-201ENST00000246024 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TMX4-201ENST00000246024 ARXQ96QS3 562 aa18.18■□□□□ 0.5
TMX4-201ENST00000246024 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.17■□□□□ 0.5
TMX4-201ENST00000246024 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.13■□□□□ 0.49
TMX4-201ENST00000246024 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.12■□□□□ 0.49
TMX4-201ENST00000246024 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
TMX4-201ENST00000246024 TSPY4P0CV99 314 aa18.1■□□□□ 0.49
TMX4-201ENST00000246024 TSPY10P0CW01 314 aa18.1■□□□□ 0.49
TMX4-201ENST00000246024 TONSLQ96HA7 1378 aa18.1■□□□□ 0.49
TMX4-201ENST00000246024 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TMX4-201ENST00000246024 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
TMX4-201ENST00000246024 RGL3Q3MIN7 710 aa18.07■□□□□ 0.48
TMX4-201ENST00000246024 ERCC6Q03468 1493 aa18.04■□□□□ 0.48
TMX4-201ENST00000246024 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
TMX4-201ENST00000246024 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.03■□□□□ 0.48
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