RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239462.8

TNN-201, Transcript of tenascin N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TNN, Length 5,008 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNN-201ENST00000239462 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.81■■■□□ 2.2
TNN-201ENST00000239462 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.33■■■□□ 2.13
TNN-201ENST00000239462 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TNN-201ENST00000239462 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.75■■□□□ 1.87
TNN-201ENST00000239462 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.55■■□□□ 1.68
TNN-201ENST00000239462 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TNN-201ENST00000239462 TRIM41Q8WV44 630 aa24.87■■□□□ 1.57
TNN-201ENST00000239462 APLP2Q06481 763 aa24.78■■□□□ 1.56
TNN-201ENST00000239462 ABCC9O60706 1549 aa24.7■■□□□ 1.54
TNN-201ENST00000239462 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
TNN-201ENST00000239462 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TNN-201ENST00000239462 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.46■■□□□ 1.51
TNN-201ENST00000239462 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TNN-201ENST00000239462 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
TNN-201ENST00000239462 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TNN-201ENST00000239462 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.19■■□□□ 1.46
TNN-201ENST00000239462 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.98■■□□□ 1.43
TNN-201ENST00000239462 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
TNN-201ENST00000239462 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TNN-201ENST00000239462 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TNN-201ENST00000239462 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.86■■□□□ 1.41
TNN-201ENST00000239462 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
TNN-201ENST00000239462 SCRIBQ14160 1630 aa23.66■■□□□ 1.38
TNN-201ENST00000239462 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
TNN-201ENST00000239462 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TNN-201ENST00000239462 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TNN-201ENST00000239462 ITGAEP38570 1179 aa23.45■■□□□ 1.34
TNN-201ENST00000239462 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TNN-201ENST00000239462 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.21■■□□□ 1.31
TNN-201ENST00000239462 HRCP23327 699 aa23.16■■□□□ 1.3
TNN-201ENST00000239462 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.14■■□□□ 1.29
TNN-201ENST00000239462 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TNN-201ENST00000239462 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.12■■□□□ 1.29
TNN-201ENST00000239462 NACADO15069 1562 aa23.09■■□□□ 1.29
TNN-201ENST00000239462 FBLN2P98095 1184 aa23.05■■□□□ 1.28
TNN-201ENST00000239462 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TNN-201ENST00000239462 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TNN-201ENST00000239462 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TNN-201ENST00000239462 P3H3Q8IVL6 736 aa22.9■■□□□ 1.26
TNN-201ENST00000239462 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.87■■□□□ 1.25
TNN-201ENST00000239462 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.77■■□□□ 1.24
TNN-201ENST00000239462 ARID3CA6NKF2 412 aa22.73■■□□□ 1.23
TNN-201ENST00000239462 TRIM52Q96A61 297 aa22.71■■□□□ 1.23
TNN-201ENST00000239462 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.66■■□□□ 1.22
TNN-201ENST00000239462 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TNN-201ENST00000239462 NEFLP07196 543 aa22.6■■□□□ 1.21
TNN-201ENST00000239462 NEUROD1Q13562 356 aa22.6■■□□□ 1.21
TNN-201ENST00000239462 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TNN-201ENST00000239462 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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TNN-201ENST00000239462 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TNN-201ENST00000239462 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
TNN-201ENST00000239462 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TNN-201ENST00000239462 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.41■■□□□ 1.18
TNN-201ENST00000239462 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.35■■□□□ 1.17
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TNN-201ENST00000239462 EEA1Q15075 1411 aa22.3■■□□□ 1.16
TNN-201ENST00000239462 CLIP1P30622 1438 aa22.3■■□□□ 1.16
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TNN-201ENST00000239462 GOLGA3Q08378 1498 aa22.21■■□□□ 1.15
TNN-201ENST00000239462 KIF27Q86VH2 1401 aa22.19■■□□□ 1.14
TNN-201ENST00000239462 CEP162Q5TB80 1403 aa22.17■■□□□ 1.14
TNN-201ENST00000239462 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TNN-201ENST00000239462 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.15■■□□□ 1.14
TNN-201ENST00000239462 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.13■■□□□ 1.13
TNN-201ENST00000239462 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
TNN-201ENST00000239462 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.11■■□□□ 1.13
TNN-201ENST00000239462 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.06■■□□□ 1.12
TNN-201ENST00000239462 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.06■■□□□ 1.12
TNN-201ENST00000239462 SMARCA2P51531 1590 aa22.06■■□□□ 1.12
TNN-201ENST00000239462 ANP32CO43423 234 aa22.04■■□□□ 1.12
TNN-201ENST00000239462 ERCC6Q03468 1493 aa22.03■■□□□ 1.12
TNN-201ENST00000239462 SOGA1O94964 1423 aa22.03■■□□□ 1.12
TNN-201ENST00000239462 WIZO95785 1651 aa22.02■■□□□ 1.12
TNN-201ENST00000239462 ABCC8Q09428 1581 aa21.96■■□□□ 1.11
TNN-201ENST00000239462 TONSLQ96HA7 1378 aa21.95■■□□□ 1.1
TNN-201ENST00000239462 TSPY4P0CV99 314 aa21.94■■□□□ 1.1
TNN-201ENST00000239462 TSPY10P0CW01 314 aa21.94■■□□□ 1.1
TNN-201ENST00000239462 CUX2O14529 1486 aa21.93■■□□□ 1.1
TNN-201ENST00000239462 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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TNN-201ENST00000239462 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.89■■□□□ 1.09
TNN-201ENST00000239462 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.87■■□□□ 1.09
TNN-201ENST00000239462 BCANQ96GW7 911 aa21.87■■□□□ 1.09
TNN-201ENST00000239462 KCNH8Q96L42 1107 aa21.87■■□□□ 1.09
TNN-201ENST00000239462 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.86■■□□□ 1.09
TNN-201ENST00000239462 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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TNN-201ENST00000239462 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TNN-201ENST00000239462 SMARCA4P51532 1647 aa21.82■■□□□ 1.08
TNN-201ENST00000239462 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.8■■□□□ 1.08
TNN-201ENST00000239462 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.77■■□□□ 1.07
TNN-201ENST00000239462 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TNN-201ENST00000239462 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.72■■□□□ 1.07
TNN-201ENST00000239462 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TNN-201ENST00000239462 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
TNN-201ENST00000239462 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.68■■□□□ 1.06
TNN-201ENST00000239462 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
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