RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000064454.11

Gcn1l1-201, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gcn1l1, Length 8,555 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rhox8Q6VSS7 320 aa19.95■□□□□ 0.78
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa18.79■□□□□ 0.6
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Cngb1E1AZ71 1325 aa18.63■□□□□ 0.57
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Wdr66E9Q743 1299 aa18.03■□□□□ 0.48
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ube2uB1AUC4 352 aa17.88■□□□□ 0.45
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Zeb1Q64318 1117 aa17.71■□□□□ 0.43
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Amer1Q7TS75 1132 aa17.71■□□□□ 0.43
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rtl1Q7M732 1744 aa17.55■□□□□ 0.4
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa17.51■□□□□ 0.39
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 CenpbP27790 599 aa17.42■□□□□ 0.38
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Npm2Q80W85 207 aa17.42■□□□□ 0.38
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Gab3Q8BSM5 595 aa17.34■□□□□ 0.37
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Stra8P70278 393 aa17.3■□□□□ 0.36
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa17.26■□□□□ 0.35
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Myt1lP97500 1187 aa17.22■□□□□ 0.35
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Trim41Q5NCC3 630 aa17.21■□□□□ 0.35
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Slc24a1Q91WD8 1130 aa17.05■□□□□ 0.32
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 NefmP08553 848 aa17.02■□□□□ 0.32
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa16.96■□□□□ 0.31
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 UbtfP25976 765 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 4933416C03RikQ3V063 378 aa16.87■□□□□ 0.29
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ccdc180J3QNE4 1664 aa16.87■□□□□ 0.29
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Myt1Q8CFC2 1127 aa16.8■□□□□ 0.28
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 NeflP08551 543 aa16.76■□□□□ 0.27
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 NrdcQ8BHG1 1161 aa16.69■□□□□ 0.26
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Tnnt3Q9QZ47 272 aa16.67■□□□□ 0.26
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 NischQ80TM9 1593 aa16.61■□□□□ 0.25
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 HrcG5E8J6 738 aa16.5■□□□□ 0.23
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 NclP09405 707 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Os9Q8K2C7 672 aa16.47■□□□□ 0.23
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Neurod1Q60867 357 aa16.44■□□□□ 0.22
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rtl5Q5DTT4 599 aa16.43■□□□□ 0.22
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Pcgf6Q99NA9 353 aa16.35■□□□□ 0.21
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Il27Q8K3I6 234 aa16.34■□□□□ 0.21
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa16.25■□□□□ 0.19
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 TonslQ6NZL6 1363 aa16.2■□□□□ 0.18
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa16.12■□□□□ 0.17
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 DaxxO35613 739 aa16.08■□□□□ 0.16
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Anp32aO35381 247 aa15.99■□□□□ 0.15
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Nlrp6Q91WS2 869 aa15.9■□□□□ 0.14
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Gm13697A2AK42 830 aa15.88■□□□□ 0.13
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa15.87■□□□□ 0.13
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 CatipB9EKE5 520 aa15.86■□□□□ 0.13
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Chic1Q8CBW7 227 aa15.86■□□□□ 0.13
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 ClspnQ80YR7 1315 aa15.82■□□□□ 0.12
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Mier1Q5UAK0 511 aa15.81■□□□□ 0.12
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Polr3glQ8R0C0 218 aa15.81■□□□□ 0.12
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 ArxO35085 564 aa15.75■□□□□ 0.11
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Atp1b4Q99ME6 356 aa15.75■□□□□ 0.11
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa15.71■□□□□ 0.11
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Erich6D3Z6S9 713 aa15.7■□□□□ 0.1
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Zbtb4Q5F293 982 aa15.69■□□□□ 0.1
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Lmod2Q3UHZ5 550 aa15.65■□□□□ 0.1
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Gm13695A2AK44 830 aa15.63■□□□□ 0.09
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa15.62■□□□□ 0.09
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa15.62■□□□□ 0.09
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa15.6■□□□□ 0.09
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Lmod3E9QA62 571 aa15.55■□□□□ 0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa15.54■□□□□ 0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Abcc9P70170 1546 aa15.54■□□□□ 0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Csrnp3P59055 597 aa15.52■□□□□ 0.07
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa15.5■□□□□ 0.07
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa15.45■□□□□ 0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Calr4Q3TQS0 420 aa15.44■□□□□ 0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Gm38655A0A286YDK6 273 aa15.43■□□□□ 0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Trim44Q9QXA7 346 aa15.41■□□□□ 0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Anks4bQ8K3X6 423 aa15.41■□□□□ 0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Aplp2Q06335 707 aa15.37■□□□□ 0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Eid3Q3V124 375 aa15.35■□□□□ 0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Vsig10D3YX43 558 aa15.34■□□□□ 0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ccer2J3QPU5 274 aa15.33■□□□□ 0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Fgd1P52734 960 aa15.32■□□□□ 0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Clip1Q922J3 1391 aa15.27■□□□□ 0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Znf326O88291 580 aa15.25■□□□□ 0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Plppr3Q7TPB0 716 aa15.23■□□□□ 0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 PtmaP26350 111 aa15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.1 ms