RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042125.14

Ttll4-201, Transcript of Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttll4, Length 10,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Cngb1E1AZ71 1325 aa13.57□□□□□ -0.24
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Rtl1Q7M732 1744 aa13.44□□□□□ -0.26
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Zeb1Q64318 1117 aa13.31□□□□□ -0.28
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Wdr66E9Q743 1299 aa13.3□□□□□ -0.28
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 Amer1Q7TS75 1132 aa12.98□□□□□ -0.33
Ttll4-201ENSMUST00000042125 NischQ80TM9 1593 aa12.9□□□□□ -0.34
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa12.88□□□□□ -0.35
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Pcgf6Q99NA9 353 aa12.81□□□□□ -0.36
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa12.78□□□□□ -0.36
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Myt1Q8CFC2 1127 aa12.77□□□□□ -0.37
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 Slc24a1Q91WD8 1130 aa12.52□□□□□ -0.4
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 UbtfP25976 765 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Myt1lP97500 1187 aa12.47□□□□□ -0.41
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Npm2Q80W85 207 aa12.45□□□□□ -0.42
Ttll4-201ENSMUST00000042125 4933416C03RikQ3V063 378 aa12.41□□□□□ -0.42
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Ttll4-201ENSMUST00000042125 Tnnt3Q9QZ47 272 aa12.37□□□□□ -0.43
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa12.3□□□□□ -0.44
Ttll4-201ENSMUST00000042125 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa12.26□□□□□ -0.45
Ttll4-201ENSMUST00000042125 HrcG5E8J6 738 aa12.22□□□□□ -0.45
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Neurod1Q60867 357 aa12.22□□□□□ -0.45
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Rtl5Q5DTT4 599 aa12.21□□□□□ -0.45
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Csrnp3P59055 597 aa12.16□□□□□ -0.46
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Gm38655A0A286YDK6 273 aa12.16□□□□□ -0.46
Ttll4-201ENSMUST00000042125 NeflP08551 543 aa12.13□□□□□ -0.47
Ttll4-201ENSMUST00000042125 TonslQ6NZL6 1363 aa12.1□□□□□ -0.47
Ttll4-201ENSMUST00000042125 NrdcQ8BHG1 1161 aa12.1□□□□□ -0.47
Ttll4-201ENSMUST00000042125 NclP09405 707 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Anp32aO35381 247 aa12.06□□□□□ -0.48
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Mier1Q5UAK0 511 aa12.06□□□□□ -0.48
Ttll4-201ENSMUST00000042125 ClspnQ80YR7 1315 aa12.04□□□□□ -0.48
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Dcaf1Q80TR8 1506 aa11.99□□□□□ -0.49
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Anks4bQ8K3X6 423 aa11.98□□□□□ -0.49
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Abcc9P70170 1546 aa11.98□□□□□ -0.49
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Aplp2Q06335 707 aa11.94□□□□□ -0.5
Ttll4-201ENSMUST00000042125 DaxxO35613 739 aa11.94□□□□□ -0.5
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa11.9□□□□□ -0.5
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Sall2Q9QX96 1004 aa11.84□□□□□ -0.51
Ttll4-201ENSMUST00000042125 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa11.79□□□□□ -0.52
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa11.77□□□□□ -0.53
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Bcl11aQ9QYE3 773 aa11.73□□□□□ -0.53
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Il27Q8K3I6 234 aa11.69□□□□□ -0.54
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Fam71e1A1L3C1 212 aa11.68□□□□□ -0.54
Ttll4-201ENSMUST00000042125 ArxO35085 564 aa11.67□□□□□ -0.54
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Calr4Q3TQS0 420 aa11.67□□□□□ -0.54
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa11.65□□□□□ -0.54
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa11.65□□□□□ -0.54
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa11.64□□□□□ -0.55
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Cep164Q5DU05 1446 aa11.63□□□□□ -0.55
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Os9Q8K2C7 672 aa11.61□□□□□ -0.55
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa11.57□□□□□ -0.56
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Eid3Q3V124 375 aa11.55□□□□□ -0.56
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Abcc8B2RUS7 1588 aa11.53□□□□□ -0.56
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
Ttll4-201ENSMUST00000042125 CatipB9EKE5 520 aa11.46□□□□□ -0.58
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Lmod3E9QA62 571 aa11.45□□□□□ -0.58
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Polr3glQ8R0C0 218 aa11.45□□□□□ -0.58
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Nlrp6Q91WS2 869 aa11.45□□□□□ -0.58
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Zbtb4Q5F293 982 aa11.44□□□□□ -0.58
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Lmod2Q3UHZ5 550 aa11.43□□□□□ -0.58
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
Ttll4-201ENSMUST00000042125 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Ccdc27Q3V036 639 aa11.41□□□□□ -0.58
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Clip1Q922J3 1391 aa11.4□□□□□ -0.58
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa11.38□□□□□ -0.59
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Vsig10D3YX43 558 aa11.36□□□□□ -0.59
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Ttll4-201ENSMUST00000042125 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Ttll4-201ENSMUST00000042125 CanxP35564 591 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Irx3P81067 507 aa11.34□□□□□ -0.59
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa11.31□□□□□ -0.6
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Mrs2Q5NCE8 434 aa11.3□□□□□ -0.6
Ttll4-201ENSMUST00000042125 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
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