RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029271.4

Trpc3-201, Transcript of Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trpc3, Length 3,694 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Rhox8Q6VSS7 320 aa27.65■■■□□ 2.02
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Rtl1Q7M732 1744 aa24.37■■□□□ 1.49
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Abcc8B2RUS7 1588 aa24.36■■□□□ 1.49
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.3■■□□□ 1.48
Trpc3-201ENSMUST00000029271 HrcG5E8J6 738 aa24.2■■□□□ 1.46
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Wdr66E9Q743 1299 aa24.12■■□□□ 1.45
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.96■■□□□ 1.43
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Myt1lP97500 1187 aa23.62■■□□□ 1.37
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Mier1Q5UAK0 511 aa23.57■■□□□ 1.36
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Sall2Q9QX96 1004 aa23.48■■□□□ 1.35
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Gm38655A0A286YDK6 273 aa23.37■■□□□ 1.33
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Cep164Q5DU05 1446 aa23.04■■□□□ 1.28
Trpc3-201ENSMUST00000029271 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa23.02■■□□□ 1.28
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.89■■□□□ 1.26
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Anks4bQ8K3X6 423 aa22.87■■□□□ 1.25
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.86■■□□□ 1.25
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.84■■□□□ 1.25
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Slc24a1Q91WD8 1130 aa22.81■■□□□ 1.24
Trpc3-201ENSMUST00000029271 TonslQ6NZL6 1363 aa22.78■■□□□ 1.24
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Eid3Q3V124 375 aa22.77■■□□□ 1.24
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Il27Q8K3I6 234 aa22.67■■□□□ 1.22
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Baz1aO88379 1555 aa22.55■■□□□ 1.2
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Kdm5dQ62240 1548 aa22.37■■□□□ 1.17
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.32■■□□□ 1.16
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.26■■□□□ 1.15
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Clip1Q922J3 1391 aa22.22■■□□□ 1.15
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Fam71e1A1L3C1 212 aa22.21■■□□□ 1.15
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Golga3P55937 1487 aa22.17■■□□□ 1.14
Trpc3-201ENSMUST00000029271 ScribQ80U72 1612 aa22.16■■□□□ 1.14
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Tnnt3Q9QZ47 272 aa22.15■■□□□ 1.14
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.15■■□□□ 1.14
Trpc3-201ENSMUST00000029271 NacadQ5SWP3 1504 aa22.12■■□□□ 1.13
Trpc3-201ENSMUST00000029271 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Stra8P70278 393 aa22.05■■□□□ 1.12
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa21.96■■□□□ 1.11
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Anp32aO35381 247 aa21.87■■□□□ 1.09
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Smarca2Q6DIC0 1577 aa21.85■■□□□ 1.09
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Calr4Q3TQS0 420 aa21.79■■□□□ 1.08
Trpc3-201ENSMUST00000029271 P3h3Q8CG70 732 aa21.75■■□□□ 1.07
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa21.74■■□□□ 1.07
Trpc3-201ENSMUST00000029271 NrdcQ8BHG1 1161 aa21.74■■□□□ 1.07
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Amer1Q7TS75 1132 aa21.69■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Cep162Q6ZQ06 1403 aa21.69■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Chic2Q9D9G3 165 aa21.68■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 BlmO88700 1416 aa21.66■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Bcl11aQ9QYE3 773 aa21.66■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Zbtb4Q5F293 982 aa21.65■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Synj1Q8CHC4 1574 aa21.64■■□□□ 1.05
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Mrs2Q5NCE8 434 aa21.55■■□□□ 1.04
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa21.53■■□□□ 1.04
Trpc3-201ENSMUST00000029271 CftrP26361 1476 aa21.52■■□□□ 1.04
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Trpc3-201ENSMUST00000029271 Sycp2Q9CUU3 1500 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Slc4a3P16283 1227 aa21.46■■□□□ 1.03
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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