RNA–Protein interactions for RNA: YLR368W

MDM30, Transcript of F-box component of an SCF ubiquitin protein ligase complex, yeastyeast

Gene MDM30, Length 1,797 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM30YLR368W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W ATP4P05626 244 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W KAR3P17119 729 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SUI2P20459 304 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SSH4P32343 579 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YKL050CP35736 922 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W EFM2P38347 419 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W RRF1P38771 230 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W PGC1Q08959 321 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W MOD5P07884 428 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W BOI1P38041 980 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W NUP82P40368 713 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W RIC1P40395 1056 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W BNA1P47096 177 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SHE10P53075 577 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W DSL1P53847 754 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W MNL2Q12205 849 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YDL206WQ12424 762 aa4.86□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W GLK1P17709 500 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W PHO87P25360 923 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W POL4P25615 582 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W VMA8P32610 256 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W COY1P34237 679 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W TIF5P38431 405 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W MGE1P38523 228 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W RGA1P39083 1007 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W FMP10P40098 244 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W MAD1P40957 749 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YJR107WP47145 328 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W HOP2P53187 214 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SPO1P53541 631 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W ERV41Q04651 352 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YPR097WQ06839 1073 aa4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data4.85□□□□□ -1.63not detected
MDM30YLR368W SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W GAL1P04385 528 aa4.84□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W RGP1P16664 663 aa4.84□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W RDS2P19541 446 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SMY2P32909 740 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data4.84□□□□□ -1.63not detected
MDM30YLR368W SAE2P46946 345 aa4.84□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W ALF1P53904 254 aa4.84□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W ATG26Q06321 1198 aa4.84□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YOL087CQ99247 1116 aa4.84□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W CDC4P07834 779 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W SWI6P09959 803 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W PGI1P12709 554 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W PMS1P14242 873 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W RED1P14291 827 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W DIT1P21623 536 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data4.83□□□□□ -1.64not detected
MDM30YLR368W DAL80P26343 269 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W GRS1P38088 690 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W PEX18P38855 283 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W PXA1P41909 870 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W JJJ1P53863 590 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W NAF1P53919 492 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W HEH2Q03281 663 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W VPS16Q03308 798 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W HED1Q03937 162 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W ARR2Q06597 130 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W MDM36Q06820 579 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W ESC8Q08119 714 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W LAP2Q10740 671 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W MCD1Q12158 566 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W TMA17Q12513 150 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data4.83□□□□□ -1.64not detected
MDM30YLR368W PDC1P06169 563 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W MCM3P24279 971 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W KIP2P28743 706 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W RME1P32338 300 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W DPH2P32461 534 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W GCD6P32501 712 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W MRS6P32864 603 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W DLD1P32891 587 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W PXA2P34230 853 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W NUP120P35729 1037 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W NOP4P37838 685 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W NIT1P40447 199 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W ESL1P40456 1118 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W BRE2P43132 505 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W HXT10P43581 546 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W YJR120WP47157 116 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W UBA2P52488 636 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W UBX4P54730 416 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data4.83□□□□□ -1.64not detected
MDM30YLR368W AOS1Q06624 347 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W MCM16Q12262 181 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W FRT1Q99332 602 aa4.83□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W YMR084WA2P2R3 262 aa4.82□□□□□ -1.64
MDM30YLR368W TRL1P09880 827 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.7 ms