RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A ROD1Q02805 837 aa5.52□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A MAG2Q06436 670 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A MCA1Q08601 432 aa5.52□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A TMA46Q12000 345 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A DED1P06634 604 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A RAD27P26793 382 aa5.51□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A YNR063WP53749 607 aa5.51□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A YPL034WQ03083 165 aa5.51□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A MKK2P32491 506 aa5.5□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A AFG2P32794 780 aa5.5□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A HSE1P38753 452 aa5.5□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A MSH4P40965 878 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A GIC2Q06648 383 aa5.5□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A LAP2Q10740 671 aa5.5□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A NAM7P30771 971 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A SMY2P32909 740 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A NNK1P36003 928 aa5.49□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A AKR1P39010 764 aa5.49□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A FAA4P47912 694 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A ALD6P54115 500 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A EEB1Q02891 456 aa5.49□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A RER2P35196 286 aa5.48□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A VAC8P39968 578 aa5.48□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A YGR053CP53234 283 aa5.48□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A CWC24P53769 259 aa5.48□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A GDE1Q02979 1223 aa5.48□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A RSA3Q05942 220 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.48□□□□□ -1.53not detected
YLR347W-AYLR347W-A RET1P22276 1149 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A NFS1P25374 497 aa5.47□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A SYP1P25623 870 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A COQ2P32378 372 aa5.47□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A ALG3P38179 458 aa5.47□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A SAF1P38352 637 aa5.47□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A VPS53P47061 822 aa5.47□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A ALT1P52893 592 aa5.47□□□□□ -1.53
YLR347W-AYLR347W-A TRP2P00899 507 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A LYP1P32487 611 aa5.46□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A QNS1P38795 714 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data5.46□□□□□ -1.54not detected
YLR347W-AYLR347W-A YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A PTC5Q12511 572 aa5.46□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A DBP5P20449 482 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A LSB3P43603 459 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A CNN1P43618 361 aa5.45□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A MTC5Q03897 1148 aa5.45□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A YLR122CQ12312 125 aa5.45□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A CHS2P14180 963 aa5.44□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A MMM1P41800 426 aa5.44□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A TYW3P53177 273 aa5.44□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A EAR1Q03212 550 aa5.44□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A TIF35Q04067 274 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A PUS7Q08647 676 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A HRK1Q08732 759 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A KAE1P36132 386 aa5.43□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A RGD1P38339 666 aa5.43□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A CIT3P43635 486 aa5.43□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A TPP1Q03796 238 aa5.43□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A FAL1Q12099 399 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A MSB1P21339 1137 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A NMD3P38861 518 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A MPH1P40562 993 aa5.42□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A SPO20Q04359 397 aa5.42□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A AOS1Q06624 347 aa5.42□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A OPI10Q08202 246 aa5.42□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A YPL260WQ08977 551 aa5.42□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A BAS1P22035 811 aa5.41□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A KIP1P28742 1111 aa5.41□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A MLS1P30952 554 aa5.41□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A YJL045WP47052 634 aa5.41□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A HNT2P49775 206 aa5.41□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A YVC1Q12324 675 aa5.41□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A PRI2P20457 528 aa5.4□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A MCM7P38132 845 aa5.4□□□□□ -1.54
YLR347W-AYLR347W-A INO1P11986 533 aa5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data5.39□□□□□ -1.55not detected
YLR347W-AYLR347W-A MOT2P34909 587 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A YKL069WP36088 180 aa5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A SEA4P38164 1038 aa5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A KRI1P42846 591 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A YGR130CP53278 816 aa5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A RCM1P53972 490 aa5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A ESC2Q06340 456 aa5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A WRS1Q12109 432 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A SPO21Q12411 609 aa5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A RKM4Q12504 494 aa5.39□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A AGP1P25376 633 aa5.38□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A ABD1P32783 436 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A YSC84P32793 468 aa5.38□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A GPB2P39717 880 aa5.38□□□□□ -1.55
YLR347W-AYLR347W-A RPN3P40016 523 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.5 ms