RNA–Protein interactions for RNA: YLL044W

YLL044W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLL044W, Length 447 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL044W	YLL044W	RAD27	P26793	382 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	GPT2	P36148	743 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	SAF1	P38352	637 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	HSE1	P38753	452 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	SPO74	P45819	413 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	VPS53	P47061	822 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	ALT1	P52893	592 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	YGR053C	P53234	283 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	GIC2	Q06648	383 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	LAP2	Q10740	671 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	AFG2	P32794	780 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	ROD1	Q02805	837 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLL044W	YLL044W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
YLL044W	YLL044W	MKK2	P32491	506 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	MAD1	P40957	749 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	EEB1	Q02891	456 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	MCA1	Q08601	432 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	COQ2	P32378	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	RER2	P35196	286 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	ATG14	P38270	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	NFS1	P25374	497 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	LYP1	P32487	611 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	RGD1	P38339	666 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	CNN1	P43618	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	CHS2	P14180	963 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	AKR1	P39010	764 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	MMM1	P41800	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	CIT3	P43635	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	KAE1	P36132	386 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	ALG3	P38179	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	MPH1	P40562	993 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	HNT2	P49775	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
YLL044W	YLL044W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	PTC5	Q12511	572 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	TYW3	P53177	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	YVC1	Q12324	675 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	YNR063W	P53749	607 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	EAR1	Q03212	550 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	RKM4	Q12504	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL044W	YLL044W	AGP1	P25376	633 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	KIP1	P28742	1111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	BAP2	P38084	609 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	VAC8	P39968	578 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	CWC24	P53769	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	RCM1	P53972	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	TPP1	Q03796	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	SPO20	Q04359	397 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	OPI10	Q08202	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	GNT1	Q12096	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	SAM35	P14693	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	YSC84	P32793	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	YJL045W	P47052	634 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	SHE9	Q04172	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	MED7	Q08278	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	MLS1	P30952	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	MDL2	P33311	773 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	PEX7	P39108	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	YJL049W	P47048	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	TNA1	P53322	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	ORC3	P54790	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	AOS1	Q06624	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	SPO21	Q12411	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL044W	YLL044W	NSI1	Q12457	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.3 ms