RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADGRB1O14514 1584 aa8.41□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.4□□□□□ -1.06
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.4□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 GCP02774 474 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSPA6P17066 643 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 ABTB2Q8N961 1025 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACEP12821 1306 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 TESK2Q96S53 571 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 NUDCQ9Y266 331 aa8.39□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITSN1Q15811 1721 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 KLHL34Q8N239 644 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 NLGN2Q8NFZ4 835 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP10DQ9P241 1426 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAPPAQ13219 1627 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF827Q17R98 1081 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC184Q52MB2 194 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDK19Q9BWU1 502 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 AKAP12Q02952 1782 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRIN3BO60391 1043 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR29P0C7W0 189 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLD1P28340 1107 aa8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL18A1P39060 1754 aa8.34□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 EXOC5O00471 708 aa8.34□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.34□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 PANK3Q9H999 370 aa8.34□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 NHSQ6T4R5 1651 aa8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADCY9O60503 1353 aa8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLIT3O75094 1523 aa8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNS2Q63HR2 1409 aa8.31□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 NLRP6P59044 892 aa8.31□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.31□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.31□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP6P35125 1406 aa8.3□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 NSD2O96028 1365 aa8.3□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa8.3□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.3□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 BTAF1O14981 1849 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIF3CO14782 793 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 NGEFQ8N5V2 710 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 APLP1P51693 650 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.28□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.28□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 ABCC6O95255 1503 aa8.28□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 RGPD5Q99666 1765 aa8.28□□□□□ -1.08
SHQ1P1-201ENST00000437111 EVC2Q86UK5 1308 aa8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP2R1AP30153 589 aa8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNQ4P56696 695 aa8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P1-201ENST00000437111 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P1-201ENST00000437111 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIK3C2AO00443 1686 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRELPP51888 382 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1P1-201ENST00000437111 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHADLQ6NUI6 762 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1P1-201ENST00000437111 CABP2Q9NPB3 220 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1P1-201ENST00000437111 CREBZFQ9NS37 354 aa8.26□□□□□ -1.09
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