RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366672.4

GALNT2-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT2, Length 4,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT2-201ENST00000366672 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.22■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 FLIIQ13045 1269 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.153e-6■■□□□ 14.4
GALNT2-201ENST00000366672 POLKQ9UBT6 870 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 PIK3C2GO75747 1445 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 VPS53Q5VIR6 699 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 FAM83GA6ND36 823 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.21■■□□□ 1.15
GALNT2-201ENST00000366672 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 ARID3AQ99856 593 aa22.2■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 ANKRD1Q15327 319 aa22.2■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.2■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 MX1P20591 662 aa22.19■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.19■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 ATP7AQ04656 1500 aa22.19■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 HYPKQ9NX55 129 aa22.18■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 ZMYM3Q14202 1370 aa22.18■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 FBXW7Q969H0 707 aa22.18■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 TPM3P06753 285 aa22.18■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 FOSBP53539 338 aa22.18■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 SKAP1Q86WV1 359 aa22.17■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.16■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 RAD21O60216 631 aa22.16■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 XBP1P17861 261 aa22.16■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.16■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 MCM4P33991 863 aa22.16■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.16■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.15■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.15■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.15■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.14■■□□□ 1.14
GALNT2-201ENST00000366672 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 TPM1P09493 284 aa22.14■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.14■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 TBX22Q9Y458 520 aa22.14■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.14■■□□□ 1.13
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GALNT2-201ENST00000366672 SDF4Q9BRK5 362 aa22.13■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 NPATQ14207 1427 aa22.13■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 KRT32Q14532 448 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 A0A1W2PP64 1363 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 MYD88Q99836 296 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.12■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 IGHDP01880 384 aa22.11■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.11■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.11■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.11■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.11■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 RNF214Q8ND24 703 aa22.1■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 TPM2P07951 284 aa22.1■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.1■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 ATP10AO60312 1499 aa22.09■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 FIBPO43427 364 aa22.09■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.09■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 PIK3R4Q99570 1358 aa22.09■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 MBD5Q9P267 1494 aa22.09■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 PIP4K2BP78356 416 aa22.09■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.08■■□□□ 1.13
GALNT2-201ENST00000366672 ZFYVE9O95405 1425 aa22.08■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 FLT4P35916 1363 aa22.08■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.08■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.08■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.08■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.08■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 ABCC1P33527 1531 aa22.07■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.07■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.07■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.07■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.07■■□□□ 1.12
GALNT2-201ENST00000366672 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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