RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306732.7

PITX2-201, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX2, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-201ENST00000306732 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX2-201ENST00000306732 RGS12O14924 1447 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX2-201ENST00000306732 NUCB2P80303 420 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX2-201ENST00000306732 KRT24Q2M2I5 525 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX2-201ENST00000306732 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX2-201ENST00000306732 DLC1Q96QB1 1528 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 SDSP20132 328 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 CEP85Q6P2H3 762 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 APBB1O00213 710 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 ZNF445P59923 1031 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 MSH6P52701 1360 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 CPS1P31327 1500 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 COG3Q96JB2 828 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 RTL1A6NKG5 1358 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PITX2-201ENST00000306732 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.2■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 MEIS3Q99687 375 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 ST18O60284 1047 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 CASC1Q6TDU7 716 aa24.18■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 MLECQ14165 292 aa24.18■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 RBSNQ9H1K0 784 aa24.18■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 GPT2Q8TD30 523 aa24.17■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.17■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.16■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.16■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 TPM2P07951 284 aa24.16■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 MCM10Q7L590 875 aa24.16■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 CHL1O00533 1208 aa24.15■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.15■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.14■■□□□ 1.46
PITX2-201ENST00000306732 REC8O95072 547 aa24.14■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 PTPRCP08575 1304 aa24.13■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 ERC2O15083 957 aa24.12■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 OFD1O75665 1012 aa24.12■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.12■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.11■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.11■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 C3P01024 1663 aa24.11■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 KIAA0232Q92628 1395 aa24.11■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.1■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.1■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 METP08581 1390 aa24.1■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.09■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 SLC4A2P04920 1241 aa24.09■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 PDE1AP54750 535 aa24.08■■□□□ 1.45
PITX2-201ENST00000306732 HS1BP3Q53T59 392 aa24.07■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.07■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.07■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 AKAP12Q02952 1782 aa24.07■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 SYCE3A1L190 88 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 F6X3S4 739 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 HMMRO75330 724 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 NEK4P51957 841 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 TMX3Q96JJ7 454 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 G2E3Q7L622 706 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 ITSN1Q15811 1721 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 CRB1P82279 1406 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX2-201ENST00000306732 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX2-201ENST00000306732 PALD1Q9ULE6 856 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX2-201ENST00000306732 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PITX2-201ENST00000306732 SALL3Q9BXA9 1300 aa24■■□□□ 1.43
PITX2-201ENST00000306732 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PITX2-201ENST00000306732 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms