RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17-201ENST00000298564 MCM10Q7L590 875 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17-201ENST00000298564 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 ABCC4O15439 1325 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 PIK3R4Q99570 1358 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 KRT24Q2M2I5 525 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 TBX22Q9Y458 520 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 SSFA2P28290 1259 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 ZMYND15Q9H091 742 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 USP31Q70CQ4 1352 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF2CQ99661 725 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 SSH2Q76I76 1423 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 PEAK1Q9H792 1746 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 DDIT3P35638 169 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 CHL1O00533 1208 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 SLIT1O75093 1534 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 GCC1Q96CN9 775 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 GBP4Q96PP9 640 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXO3O43524 673 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 AMPHP49418 695 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 APBB1O00213 710 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 KCNA6P17658 529 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 ARID3AQ99856 593 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 DIP2AQ14689 1571 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17-201ENST00000298564 NLRP6P59044 892 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 PKP1Q13835 747 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 SNX21Q969T3 373 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 SBNO1A3KN83 1393 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 FLT4P35916 1363 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 EYA1Q99502 592 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGEF10O15013 1369 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 MCTP1Q6DN14 999 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 CRB1P82279 1406 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 KIAA0232Q92628 1395 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC4A2P04920 1241 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 RGS12O14924 1447 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 AK9Q5TCS8 1911 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17-201ENST00000298564 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 KDRP35968 1356 aa21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 DCTPP1Q9H773 170 aa21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 ABTB2Q8N961 1025 aa21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 PIK3C2AO00443 1686 aa21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 PTPRCP08575 1304 aa21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 MSH6P52701 1360 aa21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 HOXC9P31274 260 aa21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 MEIS3Q99687 375 aa21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms