RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 SDSP20132 328 aa23■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 ATP10DQ9P241 1426 aa23■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 OFD1O75665 1012 aa22.99■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.99■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.99■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 ZMYND15Q9H091 742 aa22.99■■□□□ 1.27
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CNIH3-201ENST00000272133 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.98■■□□□ 1.27
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CNIH3-201ENST00000272133 NME9Q86XW9 330 aa22.98■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 GPT2Q8TD30 523 aa22.98■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.98■■□□□ 1.27
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CNIH3-201ENST00000272133 ST18O60284 1047 aa22.97■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.97■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 KRT24Q2M2I5 525 aa22.97■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 CEP85Q6P2H3 762 aa22.96■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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CNIH3-201ENST00000272133 ATP7BP35670 1465 aa22.96■■□□□ 1.27
CNIH3-201ENST00000272133 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.96■■□□□ 1.27
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CNIH3-201ENST00000272133 MSH6P52701 1360 aa22.94■■□□□ 1.26
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CNIH3-201ENST00000272133 HS1BP3Q53T59 392 aa22.92■■□□□ 1.26
CNIH3-201ENST00000272133 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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CNIH3-201ENST00000272133 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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CNIH3-201ENST00000272133 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.89■■□□□ 1.25
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CNIH3-201ENST00000272133 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.84■■□□□ 1.25
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CNIH3-201ENST00000272133 PDE1AP54750 535 aa22.82■■□□□ 1.24
CNIH3-201ENST00000272133 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.82■■□□□ 1.24
CNIH3-201ENST00000272133 DLC1Q96QB1 1528 aa22.82■■□□□ 1.24
CNIH3-201ENST00000272133 PTPRCP08575 1304 aa22.82■■□□□ 1.24
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CNIH3-201ENST00000272133 SLC4A2P04920 1241 aa22.8■■□□□ 1.24
CNIH3-201ENST00000272133 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CNIH3-201ENST00000272133 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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CNIH3-201ENST00000272133 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.79■■□□□ 1.24
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CNIH3-201ENST00000272133 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.79■■□□□ 1.24
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CNIH3-201ENST00000272133 BRD1O95696 1058 aa22.78■■□□□ 1.24
CNIH3-201ENST00000272133 MBD3O95983 291 aa22.78■■□□□ 1.24
CNIH3-201ENST00000272133 UQCRHP07919 91 aa22.78■■□□□ 1.24
CNIH3-201ENST00000272133 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
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CNIH3-201ENST00000272133 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.77■■□□□ 1.24
CNIH3-201ENST00000272133 G2E3Q7L622 706 aa22.76■■□□□ 1.23
CNIH3-201ENST00000272133 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.76■■□□□ 1.23
CNIH3-201ENST00000272133 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CNIH3-201ENST00000272133 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
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